RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544432.5

VAMP1-208, Transcript of vesicle associated membrane protein 1, human

TSL 3

Gene VAMP1, Length 759 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VAMP1-208	ENST00000544432	PROK1	P58294	105 aa		11.28	□□□□□ -0.6
VAMP1-208	ENST00000544432	IL13RA2	Q14627	380 aa		11.28	□□□□□ -0.6
VAMP1-208	ENST00000544432	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		11.28	□□□□□ -0.6
VAMP1-208	ENST00000544432	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		11.28	□□□□□ -0.6
VAMP1-208	ENST00000544432	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		11.28	□□□□□ -0.6
VAMP1-208	ENST00000544432	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		11.28	□□□□□ -0.6
VAMP1-208	ENST00000544432	DTX3	Q8N9I9	347 aa		11.28	□□□□□ -0.6
VAMP1-208	ENST00000544432	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		11.28	□□□□□ -0.6
VAMP1-208	ENST00000544432	PIFO	Q8TCI5	191 aa		11.28	□□□□□ -0.6
VAMP1-208	ENST00000544432	GPER1	Q99527	375 aa		11.28	□□□□□ -0.6
VAMP1-208	ENST00000544432	CITED1	Q99966	193 aa		11.28	□□□□□ -0.6
VAMP1-208	ENST00000544432	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		11.28	□□□□□ -0.6
VAMP1-208	ENST00000544432	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		11.28	□□□□□ -0.6
VAMP1-208	ENST00000544432	RAB18	Q9NP72	206 aa		11.28	□□□□□ -0.6
VAMP1-208	ENST00000544432	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		11.28	□□□□□ -0.6
VAMP1-208	ENST00000544432	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432		H0YJX3	145 aa		11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	GABRP	O00591	440 aa		11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	PTGFR	P43088	359 aa		11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	DYNLT3	P51808	116 aa		11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	PPP3R1	P63098	170 aa		11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	SLC34A1	Q06495	639 aa		11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432		Q499Y3	187 aa		11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	RNLS	Q5VYX0	342 aa		11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	OR52W1	Q6IF63	320 aa		11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	SATL1	Q86VE3	508 aa		11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	IL36G	Q9NZH8	169 aa		11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		11.27	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	ODAM	A1E959	279 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	XPNPEP2	O43895	674 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	BDKRB2	P30411	391 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	KIR2DS4	P43632	304 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	GLIPR1	P48060	266 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	KCNJ3	P48549	501 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	PAX5	Q02548	391 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	SCN1B	Q07699	218 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	AES	Q08117	197 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	RSU1	Q15404	277 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	STX19	Q8N4C7	294 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	COQ2	Q96H96	371 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	PPA2	Q9H2U2	334 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	IFT22	Q9H7X7	185 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	FST	P19883	344 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	CD34	P28906	385 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	WNT4	P56705	351 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	BDH1	Q02338	343 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	RIPK1	Q13546	671 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	DDI2	Q5TDH0	399 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	C11orf88	Q6PI97	169 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	AHSA2	Q719I0	299 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	CDH26	Q8IXH8	852 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	METTL9	Q9H1A3	318 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	CKLF	Q9UBR5	152 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432		A0A087X0M5	115 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432		A0A1B0GX30	115 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	MYL12B	O14950	172 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	MMP23A	O75900	390 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	CGB3	P0DN86	165 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	CGB7	P0DN87	165 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	CDK2	P24941	298 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	OR3A4P	P47883	348 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP10-3	P60369	221 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	LY6E	Q16553	131 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VAMP1-208	ENST00000544432	BRICD5	Q6PL45	260 aa		11.24	□□□□□ -0.61

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