RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 GABRA2P47869 451 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-212ENST00000541770 CAV3P56539 151 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-212ENST00000541770 PAX2Q02962 417 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-212ENST00000541770 GPR176Q14439 515 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-212ENST00000541770 RSU1Q15404 277 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-212ENST00000541770 C2orf68Q2NKX9 166 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-212ENST00000541770 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-212ENST00000541770 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.15□□□□□ -1.26
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CLSTN3-212ENST00000541770 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-212ENST00000541770 C22orf42Q6IC83 251 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-212ENST00000541770 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa7.15□□□□□ -1.26
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CLSTN3-212ENST00000541770 OR51T1Q8NGJ9 327 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-212ENST00000541770 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.15□□□□□ -1.26
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CLSTN3-212ENST00000541770 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-212ENST00000541770 S100A13Q99584 98 aa7.15□□□□□ -1.26
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CLSTN3-212ENST00000541770 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-212ENST00000541770 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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CLSTN3-212ENST00000541770 ING4Q9UNL4 249 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-212ENST00000541770 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-212ENST00000541770 MAB21L2Q9Y586 359 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-212ENST00000541770 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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CLSTN3-212ENST00000541770 SHISA3A0PJX4 238 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC17A2O00624 439 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 PDCD5O14737 125 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC22A1O15245 554 aa7.14□□□□□ -1.27
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CLSTN3-212ENST00000541770 GPR137BO60478 399 aa7.14□□□□□ -1.27
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CLSTN3-212ENST00000541770 CLPXO76031 633 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 CDRT1O95170 752 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 ECDO95905 644 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 HAND1O96004 215 aa7.14□□□□□ -1.27
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CLSTN3-212ENST00000541770 PROK1P58294 105 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 IL13RA2Q14627 380 aa7.14□□□□□ -1.27
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CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM86BQ8N661 226 aa7.14□□□□□ -1.27
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CLSTN3-212ENST00000541770 CHST4Q8NCG5 386 aa7.14□□□□□ -1.27
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CLSTN3-212ENST00000541770 GFI1Q99684 422 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 OR51E2Q9H255 320 aa7.14□□□□□ -1.27
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CLSTN3-212ENST00000541770 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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CLSTN3-212ENST00000541770 DUX4Q9UBX2 424 aa7.14□□□□□ -1.27
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CLSTN3-212ENST00000541770 ENSAO43768 121 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF737O75373 536 aa7.13□□□□□ -1.27
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CLSTN3-212ENST00000541770 GTF2F2P13984 249 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 SELLP14151 372 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 RAB3BP20337 219 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 SERPINA2P20848 420 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 HTR2CP28335 458 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 ALDH3B2P48448 385 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 CAPZA1P52907 286 aa7.13□□□□□ -1.27
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