RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	NT5C	Q8TCD5	201 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	PLIN2	Q99541	437 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	SLC25A20	O43772	301 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	SOX14	O95416	240 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	CD82	P27701	267 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	ELK4	P28324	431 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	HTR4	Q13639	388 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760		Q499Y3	187 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	ELP2	Q6IA86	826 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	OR4X1	Q8NH49	305 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	CMBL	Q96DG6	245 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	FMC1	Q96HJ9	113 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	RILP	Q96NA2	401 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	LINC01587	Q99440	93 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	POMK	Q9H5K3	350 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	AHSP	Q9NZD4	102 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	BTRC	Q9Y297	605 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	SBNO1	A3KN83	1393 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	COA5	Q86WW8	74 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	NDNF	Q8TB73	568 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	PEX13	Q92968	403 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	TMBIM1	Q969X1	311 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	OR2M4	Q96R27	311 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	C6orf50	Q9HD87	102 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	CD300LB	A8K4G0	201 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	DNAJB6	O75190	326 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	HSBP1	O75506	76 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	OR5AL1	P0C617	328 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	OR2B6	P58173	313 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	CCL17	Q92583	94 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	REEP6	Q96HR9	211 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	OLFM3	Q96PB7	478 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	COA1	Q9GZY4	146 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	DOK5	Q9P104	306 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	ATRN	O75882	1429 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760		A0A1B0GVG6	124 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760		A8MWP6	167 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	TRAPPC6A	O75865	159 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	CRYGD	P07320	174 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	ALOX5AP	P20292	161 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	MSR1	P21757	451 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	GABRR2	P28476	465 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	IL12B	P29460	328 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	XK	P51811	444 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	CLDN18	P56856	261 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
CDK1-208	ENST00000519760	BNIP2	Q12982	314 aa		0.19	□□□□□ -2.38

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