RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512392.5

CHD1-208, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene CHD1, Length 1,968 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD1-208	ENST00000512392	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	MEST	Q5EB52	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	STEAP4	Q687X5	459 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ZFP90	Q8TF47	636 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	SIX2	Q9NPC8	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	FAM25A	B3EWG3	89 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	FAM25C	B3EWG5	89 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	FAM25G	B3EWG6	89 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392		H3BP45	60 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	PIAS1	O75925	651 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	IL1RN	P18510	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	RAB3A	P20336	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	CD70	P32970	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	HPCA	P84074	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392		Q0VFX4	171 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	BAMBI	Q13145	260 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	OR4S2	Q8NH73	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	KLK6	Q92876	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	PTX4	Q96A99	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	CCDC115	Q96NT0	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF382	Q96SR6	550 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	RLF	Q13129	1914 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	PTPRJ	Q12913	1337 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392		H0Y9J4	135 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	C6orf47	O95873	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	PSMB9	P28065	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	MAX	P61244	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	RELA	Q04206	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	NEDD8	Q15843	81 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	BMF	Q96LC9	184 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	MND1	Q9BWT6	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	IL25	Q9H293	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	PTPRK	Q15262	1439 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	MIA2	Q96PC5	1412 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	DEGS1	O15121	323 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	RGS5	O15539	181 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	RAMP2	O60895	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	NXPH4	O95158	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	SLPI	P03973	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	OR5G3	P0C626	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	FOLR2	P14207	255 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	AKR1D1	P51857	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	RUNX3	Q13761	415 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	QPRT	Q15274	297 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF550	Q7Z398	422 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	C18orf12	Q96KH6	178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	EBPL	Q9BY08	206 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	WDR97	A6NE52	1622 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392		K7EQG2	157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	PTH	P01270	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	UBB	P0CG47	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	FGF6	P10767	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	FMO3	P31513	532 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	OR8B8	Q15620	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	CCL14	Q16627	93 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	NRF1	Q16656	503 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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