RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 DOCK7Q96N67 2140 aa4.8□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARPC5LQ9BPX5 153 aa4.8□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 VKORC1Q9BQB6 163 aa4.8□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 NICN1Q9BSH3 213 aa4.8□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF416Q9BWM5 594 aa4.8□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 SFXN3Q9BWM7 321 aa4.8□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM59Q9BXS4 323 aa4.8□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 DNTTIP1Q9H147 329 aa4.8□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR10A2Q9H208 303 aa4.8□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM38BQ9NVV0 291 aa4.8□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLEK2Q9NYT0 353 aa4.8□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 SHPKQ9UHJ6 478 aa4.8□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRSS50Q9UI38 385 aa4.8□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 TINAGQ9UJW2 476 aa4.8□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNK7Q9Y2U2 307 aa4.8□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATMQ13315 3056 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 C5orf51A6NDU8 294 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR2AT4A6NND4 320 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 CEACAM18A8MTB9 384 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 LGALS8O00214 317 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 RER1O15258 196 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 SOCS1O15524 211 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 SGCEO43556 437 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 CA11O75493 328 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 SFT2D2O95562 160 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGLV3-1P01715 115 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRF1P14222 555 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 AMY2BP19961 511 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 BMP5P22003 454 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRKACBP22694 351 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 IL32P24001 234 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 PSMB6P28072 239 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 SERPINF1P36955 418 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 CA7P43166 264 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 ALDH3B1P43353 468 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM50BP56557 158 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 TAS2R46P59540 309 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 RAB1AP62820 205 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 HIST1H3AP68431 136 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 CYCSP99999 105 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRTAP1-1Q07627 177 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 FOXF2Q12947 444 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPA1Q15181 289 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 TESK1Q15569 626 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 MICBQ29980 383 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM128Q5BJH2 165 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLAC9Q5JTB6 97 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGFL4Q6B9Z1 124 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 VWA1Q6PCB0 445 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 TFAP2EQ6VUC0 442 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 Q6ZSR3 168 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 MOB3CQ70IA8 216 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 HIST2H3AQ71DI3 136 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 RTN4RL2Q86UN3 420 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 SKA3Q8IX90 412 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 STPG2Q8N412 459 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM89BQ8N5H3 189 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM104Q8NE00 496 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM185AQ8NFB2 350 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR51T1Q8NGJ9 327 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR13G1Q8NGZ3 307 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 TERB2Q8NHR7 220 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 Q8TCH9 128 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 SSC4DQ8WTU2 575 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 DCUN1D4Q92564 292 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 C10orf35Q96D05 121 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPACA5Q96QH8 159 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 DMRTA2Q96SC8 542 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 SOX7Q9BT81 388 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 NMES1Q9C002 83 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 SHARPINQ9H0F6 387 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 BANF2Q9H503 90 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 RAB18Q9NP72 206 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 ELOVL5Q9NYP7 299 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF319Q9P2F9 582 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 MBD2Q9UBB5 411 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPR132Q9UNW8 380 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 MEMO1Q9Y316 297 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM215AQ9Y5M1 114 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 V9GYS6 101 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 ITPR1Q14643 2758 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 CACNA1CQ13936 2221 aa4.78□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 FREM1Q5H8C1 2179 aa4.78□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa4.78□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms