RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496298.5

USP40-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-217ENST00000496298 WIPF1O43516 503 aa15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 ALDOBP05062 364 aa15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 ZNF44P15621 663 aa15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 GLIPR1P48060 266 aa15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 RAB13P51153 203 aa15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 AESQ08117 197 aa15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 LRRC36Q1X8D7 754 aa15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 OR52W1Q6IF63 320 aa15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 ZNF485Q8NCK3 441 aa15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 SETD9Q8NE22 299 aa15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 OR51A2Q8NGJ7 313 aa15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 OR51T1Q8NGJ9 327 aa15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 CYGBQ8WWM9 190 aa15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 COQ2Q96H96 371 aa15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 SIGLEC9Q9Y336 463 aa15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa15.64■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 ODAMA1E959 279 aa15.63■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 GABRPO00591 440 aa15.63■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 DEGS1O15121 323 aa15.63■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 CD2P06729 351 aa15.63■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 SOX2P48431 317 aa15.63■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 SCN1BQ07699 218 aa15.63■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 FAM189A2Q15884 450 aa15.63■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa15.63■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 Q8N2B8 174 aa15.63■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 DHRSXQ8N5I4 330 aa15.63■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 OR4P4Q8NGL7 312 aa15.63■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 OR52N1Q8NH53 320 aa15.63■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 OR2T6Q8NHC8 308 aa15.63■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 SMIM19Q96E16 107 aa15.63■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 TAS2R4Q9NYW5 299 aa15.63■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 PITPNC1Q9UKF7 332 aa15.63■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 FAM90A22PA8MWA6 464 aa15.62■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 MAGEB3O15480 346 aa15.62■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 LALBAP00709 142 aa15.62■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 CGB3P0DN86 165 aa15.62■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 CGB7P0DN87 165 aa15.62■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 CD34P28906 385 aa15.62■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 BDH1Q02338 343 aa15.62■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 PAX5Q02548 391 aa15.62■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 RCN1Q15293 331 aa15.62■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 RTN4RL2Q86UN3 420 aa15.62■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 ABHD12Q8N2K0 398 aa15.62■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 CFHR4Q92496 578 aa15.62■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 TMEM106AQ96A25 262 aa15.62■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 TMEM80Q96HE8 168 aa15.62■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 ABCB10Q9NRK6 738 aa15.62■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 CLEC2DQ9UHP7 191 aa15.62■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 ZNF281Q9Y2X9 895 aa15.62■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 NOTCH1P46531 2555 aa15.62■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 IGLV1-47P01700 117 aa15.61■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 MYL12AP19105 171 aa15.61■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 CDK2P24941 298 aa15.61■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 HTR1DP28221 377 aa15.61■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 IL13RA2Q14627 380 aa15.61■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 HERPUD1Q15011 391 aa15.61■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 PLA1AQ53H76 456 aa15.61■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 KRBOX4Q5JUW0 171 aa15.61■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa15.61■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa15.61■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 GGHQ92820 318 aa15.61■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 GPER1Q99527 375 aa15.61■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 ZNF702PQ9H963 129 aa15.61■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 TMEM138Q9NPI0 162 aa15.61■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 HILPDAQ9Y5L2 63 aa15.61■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 A0A087X0M5 115 aa15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 TRAV24A0A0B4J272 114 aa15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 A0A1B0GX30 115 aa15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 GPX5O75715 221 aa15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 GDNFP39905 211 aa15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 PTGFRP43088 359 aa15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 C17orf58Q2M2W7 97 aa15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 NHLRC3Q5JS37 347 aa15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 LAIR2Q6ISS4 152 aa15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 SATL1Q86VE3 508 aa15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 ZNF596Q8TC21 504 aa15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 FBLIM1Q8WUP2 373 aa15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 GHSRQ92847 366 aa15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 LINC00574Q9H8X3 128 aa15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 SERTAD4Q9NUC0 356 aa15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 IL36GQ9NZH8 169 aa15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 OR6C3Q9NZP0 311 aa15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 DPM3Q9P2X0 92 aa15.6■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 H0YJX3 145 aa15.59■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 KCNAB3O43448 404 aa15.59■□□□□ 0.09
USP40-217ENST00000496298 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms