RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa9.78□□□□□ -0.84
NISCH-211ENST00000488243 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
NISCH-211ENST00000488243 ZNF222Q9UK12 451 aa9.78□□□□□ -0.84
NISCH-211ENST00000488243 ZANQ9Y493 2812 aa9.78□□□□□ -0.84
NISCH-211ENST00000488243 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PP11 408 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 C3orf80F5H4A9 247 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 LYNX1G3V0Z9 82 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 SIGLEC5O15389 551 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 OR2H2O95918 312 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CSN2P05814 226 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 LYNX1P0DP58 116 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ZNF44P15621 663 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 GABRR1P24046 479 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CHATP28329 748 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 TNFSF8P32971 234 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 VEGFCP49767 419 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 NPY4RP50391 375 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 EFNB2P52799 333 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ZNF45Q02386 682 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 SPANXN2Q5MJ10 180 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 Q6P435 159 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 NLRC3Q7RTR2 1065 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 LAX1Q8IWV1 398 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ZNF525Q8N782 197 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 DIRAS2Q96HU8 199 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 TMEM246Q9BRR3 403 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 MIXL1Q9H2W2 232 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ARID1AO14497 2285 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ROS1P08922 2347 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 VWC2LB2RUY7 222 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 SULT1C2O00338 296 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 LY6HO94772 140 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 MELTFP08582 738 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CDK2P24941 298 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ERP29P30040 261 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CARTPTQ16568 116 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 TMEM69Q5SWH9 247 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 PYHIN1Q6K0P9 492 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CCDC190Q86UF4 302 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CD177Q8N6Q3 437 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 DEFB108BQ8NET1 73 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 RAB39BQ96DA2 213 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 DMRTB1Q96MA1 342 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 KCNK15Q9H427 330 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 DCAF16Q9NXF7 216 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 EXTL2Q9UBQ6 330 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 LPAR3Q9UBY5 353 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 OR14J1Q9UGF5 321 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 MGAT4AQ9UM21 535 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 PCDHB10Q9UN67 800 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 MXRA5Q9NR99 2828 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 DYSFO75923 2080 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 A0A0A6YYD4 124 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ISPDA4D126 451 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 FABP12A6NFH5 140 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 RNF212BA8MTL3 300 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 K7N7A8 449 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 MGST3O14880 152 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CTDSPLO15194 276 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 TMPRSS2O15393 492 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 SOCS1O15524 211 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ADAM20O43506 726 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 NDUFB3O43676 98 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ZNF737O75373 536 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 GYPAP02724 150 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 TK1P04183 234 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CBX5P45973 191 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 GABRA2P47869 451 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 TMEM50BP56557 158 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 GMFBP60983 142 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 COL10A1Q03692 680 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CLEC12BQ2HXU8 276 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ZNF260Q3ZCT1 412 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CDNFQ49AH0 187 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 FAM201AQ5SY85 155 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ATAD3CQ5T2N8 411 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 SIGIRRQ6IA17 410 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CNIH2Q6PI25 160 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 OR8H2Q8N162 312 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 SUMF2Q8NBJ7 301 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 OR8B3Q8NGG8 313 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 GAFA1Q96PS6 74 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 OR8B2Q96RD0 313 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 SOSTQ9BQB4 213 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 NICN1Q9BSH3 213 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms