RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	DUSP1	P28562	367 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	PIGY	Q3MUY2	71 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	C22orf42	Q6IC83	251 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	TCF23	Q7RTU1	214 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	TPRA1	Q86W33	373 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM104	Q8NE00	496 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	WDFY2	Q96P53	400 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	BEX2	Q9BXY8	128 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	CST11	Q9H112	138 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	OR51E2	Q9H255	320 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	SSR3	Q9UNL2	185 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290		V9GY05	133 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	LDLRAD4	O15165	306 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	VSIG8	P0DPA2	414 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	CALCB	P10092	127 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	GADD45A	P24522	165 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	DLX6	P56179	175 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	RIPPLY3	P57055	190 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	UNC119	Q13432	240 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290		Q8N7P7	452 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	NANP	Q8TBE9	248 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	TBX15	Q96SF7	602 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	TM2D1	Q9BX74	207 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	AIP	O00170	330 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	SIRPB1	O00241	398 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	DEGS1	O15121	323 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	GLA	P06280	429 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF44	P15621	663 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	MGMT	P16455	207 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	SRD5A1	P18405	259 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	P2RX3	P56373	397 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	GRK1	Q15835	563 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	CORO2A	Q92828	525 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	TNFRSF14	Q92956	283 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	COQ2	Q96H96	371 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	KCTD7	Q96MP8	289 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	IFITM5	A6NNB3	132 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290		H3BUI4	141 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB3B	P20337	219 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	GABRR1	P24046	479 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	ALDH3B2	P48448	385 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	BPIFB3	P59826	476 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	SCGB2A2	Q13296	93 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF273	Q14593	569 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	PDCD1	Q15116	288 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB11B	Q15907	218 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	GAPT	Q8N292	157 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	CHST6	Q9GZX3	395 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A1W2PPH5	198 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	FUOM	A2VDF0	154 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	C17orf98	A8MV24	154 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM127	O75204	238 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	TOX4	O94842	621 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	PRTN3	P24158	256 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	CENPO	Q9BU64	300 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	PPA2	Q9H2U2	334 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A1W2PQ09	198 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	hADV38S2	A0JD32	116 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	NOTO	A8MTQ0	251 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	TFAP2A	P05549	437 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	ARSB	P15848	533 aa		13.59	□□□□□ -0.23

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