RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 RFNGQ9Y644 331 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 LCATP04180 440 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CHRNB4P30926 498 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 LGALS7P47929 136 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PRSS12P56730 875 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PAX5Q02548 391 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 GRHL3Q8TE85 626 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 MCHR1Q99705 422 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 GLOD5A6NK44 160 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CYB5AP00167 134 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 GYPBP06028 91 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CCL3P10147 92 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 FUT1P19526 365 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 MAKP20794 623 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SERPINA2P20848 420 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZNF563Q8TA94 476 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 THRSPQ92748 146 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SLC7A7Q9UM01 511 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 XKRY2A2RUG3 117 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZIC3O60481 467 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 JTBO76095 146 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CD37P11049 281 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SRD5A2P31213 254 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 UBE2V1Q13404 147 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 DCST2Q5T1A1 773 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 LRP11Q86VZ4 500 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZNF101Q8IZC7 436 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZPLD1Q8TCW7 415 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TTTY12Q9BZ98 90 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 GP6Q9HCN6 339 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 IL19Q9UHD0 177 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.65□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 NPIPB7O75200 414 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 HPRT1P00492 218 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 DANCRP0C864 163 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR13C7P0DN81 318 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PRPS1P60891 318 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 DLK1P80370 383 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 VWA1Q6PCB0 445 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 STPG4Q8N801 248 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SLC35G3Q8N808 338 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ABHD3Q8WU67 409 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TAAR8Q969N4 342 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 RAB39BQ96DA2 213 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 INTS14Q96SY0 518 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR8D2Q9GZM6 311 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SPTBP11277 2137 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.65□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 A0A0G2JMM0 328 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PPB8 328 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PRS3 328 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 C20orf202A1L168 122 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 KIR3DP1A8MWS1 328 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 DNPH1O43598 174 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MMP23AO75900 390 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PET100P0DJ07 73 aa6.64□□□□□ -1.35
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