RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 MAS1P04201 325 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 GIMD1P0DJR0 217 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 SMIM17P0DL12 118 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 ZNF28P17035 718 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 SERPINA2P20848 420 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 FUT3P21217 361 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 SFTPDP35247 375 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 CTRLP40313 264 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 PRLHRP49683 370 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 PGFP49763 221 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 RAB28P51157 221 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 TBPL1P62380 186 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 NTHL1P78549 312 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 ARF5P84085 180 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 DUSP2Q05923 314 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 EFEMP1Q12805 493 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 OR1Q1Q15612 314 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 EXT1Q16394 746 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 MPV17LQ2QL34 196 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 ALG10Q5BKT4 473 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 LINC01590Q5TEZ4 76 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 PRR27Q6MZM9 219 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 TMEM56Q96MV1 263 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 WDR76Q9H967 626 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 MYOFQ9NZM1 2061 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 NCOR1O75376 2440 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 A0A0A6YYD5 115 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 A0A0B4J2E0 115 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 A0A1B0GX12 115 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 OR5B21A6NL26 309 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 LEFTY2O00292 366 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 ST8SIA3O43173 380 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 NDUFB8O95169 186 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 OR6A2O95222 327 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 C1orf105O95561 183 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 IGHEP01854 428 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 ERGP11308 486 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 F3P13726 295 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 CEBPBP17676 345 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 PSMB5P28074 263 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 HRH1P35367 487 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 GABRA2P47869 451 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 SPINT3P49223 89 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 CLDN6P56747 220 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 S100A10P60903 97 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 LCN6P62502 163 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 SRPXP78539 464 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 TFF2Q03403 129 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 RBPJQ06330 500 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 TCF15Q12870 199 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 FOXL1Q12952 345 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 FHL1Q13642 323 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 GPR18Q14330 331 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 PMCHL1Q16048 86 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 ZNF836Q6ZNA1 936 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 C1orf174Q8IYL3 243 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 STPG3Q8N7X2 389 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 OR52E2Q8NGJ4 325 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 OR6N2Q8NGY6 317 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 TMEM234Q8WY98 164 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 PGAM5Q96HS1 289 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 MACROD1Q9BQ69 325 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 KXD1Q9BQD3 176 aa6.23□□□□□ -1.41
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