RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 PGLYRP3Q96LB9 341 aa5.71□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.71□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 BARHL1Q9BZE3 327 aa5.71□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 TLNRD1Q9H1K6 362 aa5.71□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 WDR13Q9H1Z4 485 aa5.71□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 ZMAT4Q9H898 229 aa5.71□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 ABCB10Q9NRK6 738 aa5.71□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 C19orf12Q9NSK7 152 aa5.71□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 SNTG1Q9NSN8 517 aa5.71□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 C14orf119Q9NWQ9 140 aa5.71□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 KCNG2Q9UJ96 466 aa5.71□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 LAMP5Q9UJQ1 280 aa5.71□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 PKHD1P08F94 4074 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 SHISA3A0PJX4 238 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 SMIM30A4D0T7 59 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 RPP14O95059 124 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 CDRT1O95170 752 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 AMY1AP04745 511 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 AMY2AP04746 511 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 KRT8P05787 483 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 LPLP06858 475 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 SLC6A1P30531 599 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 SDC2P34741 201 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 OPRL1P41146 370 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 BLVRAP53004 296 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 TAS2R43P59537 309 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 MXD1Q05195 221 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 MZT1Q08AG7 82 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 SSX2Q16385 188 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM200BQ69YZ2 307 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 DNM1P34Q6PK57 102 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 CFAP77Q6ZQR2 320 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 FAM185AQ8N0U4 392 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 OSR2Q8N2R0 312 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 ZNRF1Q8ND25 227 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 OR56B2PQ8NGI1 322 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 OR2AE1Q8NHA4 323 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 OTOSQ8NHW6 89 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 THEM6Q8WUY1 208 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 GHSRQ92847 366 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 KCTD7Q96MP8 289 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 DUX3Q96PT4 197 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 OR8B4Q96RC9 309 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 MNTQ99583 582 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 GGT3PA6NGU5 568 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 CDIPTO14735 213 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 SC5DO75845 299 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 SULT1C4O75897 302 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 IL1AP01583 271 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF823P16415 610 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 DLX6P56179 175 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 CCDC58Q4VC31 144 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 ABCA11PQ4W5N1 156 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 GLYATL3Q5SZD4 288 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 FAM27D1Q5T7N8 215 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF626Q68DY1 528 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 C16orf82Q7Z2V1 217 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 FAM220AQ7Z4H9 259 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 CEACAM19Q7Z692 300 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 LINC00346Q8IVM7 164 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 MFSD4AQ8N468 514 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 YIPF7Q8N8F6 280 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF454Q8N9F8 522 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 OR10Z1Q8NGY1 313 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 SMIM19Q96E16 107 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 RAX2Q96IS3 184 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 ATF6BQ99941 703 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 ABHD6Q9BV23 337 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 AKIP1Q9NQ31 210 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 ZFP57Q9NU63 452 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF222Q9UK12 451 aa5.69□□□□□ -1.5
CASQ1-203ENST00000481081 IKZF2Q9UKS7 526 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms