RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 USP43Q70EL4 1123 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 Q8NFD4 153 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 OR51T1Q8NGJ9 327 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 SDSLQ96GA7 329 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 MED30Q96HR3 178 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 LPAR2Q9HBW0 351 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 GHRLQ9UBU3 117 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 GLS2Q9UI32 602 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM82A0PJX8 343 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 HSPB6O14558 160 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 LDLRAD4O15165 306 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 SIGLEC5O15389 551 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 NDUFB3O43676 98 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 HEXAP06865 529 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 NDUFB7P17568 137 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 GABRR1P24046 479 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 CFPP27918 469 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 PITPNBP48739 271 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 GNB2P62879 340 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 IL13RA1P78552 427 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 LCN2P80188 198 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 IL13RA2Q14627 380 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF561Q8N587 486 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 OR5H6Q8NGV6 325 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 ST8SIA4Q92187 359 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB39BQ96DA2 213 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 CYYR1Q96J86 154 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 NICN1Q9BSH3 213 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 CHST6Q9GZX3 395 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 CST11Q9H112 138 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A0A6YYD4 124 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 K7N7A8 449 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 SOCS1O15524 211 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 PSPNO60542 156 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF737O75373 536 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 TK1P04183 234 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 CD99P14209 185 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 LMO1P25800 156 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 OR3A1P47881 315 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 RORCP51449 518 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 MLANAQ16655 118 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 ESCO2Q56NI9 601 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 BIVMQ86UB2 503 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 C1orf159Q96HA4 380 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 C18orf12Q96KH6 178 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 SNX22Q96L94 193 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 PPA2Q9H2U2 334 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-208ENST00000463533 ING3Q9NXR8 418 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms