RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428637.5

RAPH1-208, Transcript of Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, human

TSL 2

Gene RAPH1, Length 585 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAPH1-208	ENST00000428637	ACTC1	P68032	377 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	ACTA1	P68133	377 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	EFNB1	P98172	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	SLC34A1	Q06495	639 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	UBE2V2	Q15819	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637		Q6ZSR3	168 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	MRAP	Q8TCY5	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	SLAMF9	Q96A28	289 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	BORCS8	Q96FH0	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	SNX22	Q96L94	193 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	ZNF714	Q96N38	554 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	TBX5	Q99593	518 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	POMP	Q9Y244	141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637		G3V2T6	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	SULT1C4	O75897	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	HAND1	O96004	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	HTR1D	P28221	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	EPHA2	P29317	976 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	ATP1B3	P54709	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	IL18R1	Q13478	541 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	GRK1	Q15835	563 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	C12orf73	Q69YU5	71 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	SSX6	Q7RTT6	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	GID4	Q8IVV7	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637		Q8IYB0	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	PP6455	Q8WZ26	134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	STMN2	Q93045	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	CHST5	Q9GZS9	411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	GLS2	Q9UI32	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	FUOM	A2VDF0	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	SH2D1B	O14796	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	MGST3	O14880	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	OR2T7	P0C7T2	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	PRKACA	P17612	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	BCL3	P20749	454 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	PRKACB	P22694	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	DUSP1	P28562	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	HTR1F	P30939	366 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	BRS3	P32247	399 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	NPBWR2	P48146	333 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	POU3F4	P49335	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	RBP2	P50120	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	ARHGDIB	P52566	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAPH1-208	ENST00000428637	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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