RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422939.1

TRPS1-204, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRPS1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-204ENST00000422939 SMARCD1Q96GM5 515 aa2.77□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 UBAP1Q9NZ09 502 aa2.77□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 ENOPH1Q9UHY7 261 aa2.77□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa2.77□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 MYO5CQ9NQX4 1742 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 A0A1B0GVX0 72 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 CENPBD1B2RD01 187 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 SCO1O75880 301 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 PAX6P26367 422 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 PRSS3P35030 304 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 CD164Q04900 197 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 TMEM249Q2WGJ8 235 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 ABCA11PQ4W5N1 156 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 YIF1BQ5BJH7 314 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 WDFY1Q8IWB7 410 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 OR4M1Q8NGD0 313 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 GHSRQ92847 366 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 TNFRSF14Q92956 283 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 SMIM8Q96KF7 97 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 OR4K3Q96R72 315 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 PITX2Q99697 317 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 SDHAF3Q9NRP4 125 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 EURLQ9NYK6 297 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 ZNRD1Q9P1U0 126 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 PRO0628Q9UI54 55 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 SNX24Q9Y343 169 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 PPIL1Q9Y3C6 166 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 ENPP4Q9Y6X5 453 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 DOCK9Q9BZ29 2069 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 SCN11AQ9UI33 1791 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 PXDNQ92626 1479 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 QSER1Q2KHR3 1735 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 HFM1A2PYH4 1435 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 NOS1P29475 1434 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 DCCP43146 1447 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 COL4A5P29400 1685 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 USP24Q9UPU5 2620 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 SAMD9Q5K651 1589 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 ELP1O95163 1332 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 ABCB11O95342 1321 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 UPK2O00526 184 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 ITGB1BP1O14713 200 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 AQP9O43315 295 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 NIPSNAP2O75323 286 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 RBBP9O75884 186 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 CTDNEP1O95476 244 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 APCSP02743 223 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 RD3LP0DJH9 198 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 TEAD1P28347 426 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 GTF2H1P32780 548 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 TTPAP49638 278 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 SLC18A1P54219 525 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 UBE2G2P60604 165 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 RHOAP61586 193 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 RAB31Q13636 194 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 PMVKQ15126 192 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 AP1ARQ63HQ0 302 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 Q6ZT83 130 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 BOD1L2Q8IYS8 172 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 TMEM256Q8N2U0 113 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 SPICQ8N5J4 248 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 LRRC52Q8N7C0 313 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 CCNYL1Q8N7R7 359 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 OR6N1Q8NGY5 312 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 BLNKQ8WV28 456 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 C22orf15Q8WYQ4 148 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 RBBP8Q99708 897 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 APOL4Q9BPW4 351 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 NDFIP1Q9BT67 221 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 GGTLC1Q9BX51 225 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 SAMD10Q9BYL1 202 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 OR52D1Q9H346 318 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 ASCL3Q9NQ33 180 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 DDIT4Q9NX09 232 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 SLC22A14Q9Y267 594 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 KIAA0232Q92628 1395 aa2.74□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 TPRP12270 2363 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 KNDC1Q76NI1 1749 aa2.74□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 SBF1O95248 1867 aa2.74□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 C1orf167Q5SNV9 1468 aa2.74□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa2.74□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 A0A0U1RQV1 116 aa2.74□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 GOLGA6L10A6NI86 522 aa2.74□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 M0QXV9 152 aa2.74□□□□□ -1.97
TRPS1-204ENST00000422939 BPY2O14599 106 aa2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms