RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 PGLYRP3Q96LB9 341 aa16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 PPA2Q9H2U2 334 aa16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 C16orf95Q9H693 158 aa16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF696Q9H7X3 374 aa16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM138Q9NPI0 162 aa16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 RNF114Q9Y508 228 aa16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 DEGS1O15121 323 aa16.69■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 ARG1P05089 322 aa16.69■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 TAS2R43P59537 309 aa16.69■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP16.69■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 AESQ08117 197 aa16.69■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 AHSA2Q719I0 299 aa16.69■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 ZFP41Q8N8Y5 198 aa16.69■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 OR51T1Q8NGJ9 327 aa16.69■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 MALSU1Q96EH3 234 aa16.69■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 FKBP14Q9NWM8 211 aa16.69■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 SESN1Q9Y6P5 492 aa16.69■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa16.68■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 GPX5O75715 221 aa16.68■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 CLPXO76031 633 aa16.68■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 PTGFRP43088 359 aa16.68■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 GLIPR1P48060 266 aa16.68■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP3R1P63098 170 aa16.68■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 Q499Y3 187 aa16.68■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 PRR31Q5SQ13 230 aa16.68■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa16.68■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa16.68■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 STX19Q8N4C7 294 aa16.68■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 PIFOQ8TCI5 191 aa16.68■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 ORAI1Q96D31 301 aa16.68■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 COQ2Q96H96 371 aa16.68■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 CMYA5Q8N3K9 4069 aa16.67■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 VGLL3A8MV65 326 aa16.67■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 H0YJX3 145 aa16.67■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 BDKRB2P30411 391 aa16.67■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 OR3A4PP47883 348 aa16.67■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 WNT4P56705 351 aa16.67■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 PROK1P58294 105 aa16.67■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 IL13RA2Q14627 380 aa16.67■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 RSU1Q15404 277 aa16.67■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 LY6EQ16553 131 aa16.67■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 DDI2Q5TDH0 399 aa16.67■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 DYNAPQ8N1N2 210 aa16.67■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 NRG4Q8WWG1 115 aa16.67■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM192AQ9GZU8 254 aa16.67■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM133Q9H2Q1 129 aa16.67■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 TAS2R3Q9NYW6 316 aa16.67■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa16.66■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 ODAMA1E959 279 aa16.66■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 MYL12BO14950 172 aa16.66■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 MMP23AO75900 390 aa16.66■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 CD1AP06126 327 aa16.66■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 RIPK1Q13546 671 aa16.66■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 KRBOX4Q5JUW0 171 aa16.66■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 HEPN1Q6WQI6 88 aa16.66■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 NANOGP1Q8N7R0 232 aa16.66■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 OR10K1Q8NGX5 313 aa16.66■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 CITED1Q99966 193 aa16.66■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa16.66■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 IL36GQ9NZH8 169 aa16.66■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 TRAV24A0A0B4J272 114 aa16.65■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 CDRT1O95170 752 aa16.65■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 CELP19835 753 aa16.65■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 KRTAP10-3P60369 221 aa16.65■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 SSX2Q16385 188 aa16.65■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 MINOS1Q5TGZ0 78 aa16.65■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC35E4Q6ICL7 350 aa16.65■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 OR52W1Q6IF63 320 aa16.65■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 CLEC7AQ9BXN2 247 aa16.65■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 RAB18Q9NP72 206 aa16.65■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 CKLFQ9UBR5 152 aa16.65■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa16.65■□□□□ 0.26
UBE2E3-201ENST00000392415 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa16.64■□□□□ 0.25
UBE2E3-201ENST00000392415 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa16.64■□□□□ 0.25
UBE2E3-201ENST00000392415 HTR3BO95264 441 aa16.64■□□□□ 0.25
UBE2E3-201ENST00000392415 FSTP19883 344 aa16.64■□□□□ 0.25
UBE2E3-201ENST00000392415 CDK2P24941 298 aa16.64■□□□□ 0.25
UBE2E3-201ENST00000392415 AQP4P55087 323 aa16.64■□□□□ 0.25
UBE2E3-201ENST00000392415 DOC2BQ14184 412 aa16.64■□□□□ 0.25
UBE2E3-201ENST00000392415 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
UBE2E3-201ENST00000392415 PIGYQ3MUY2 71 aa16.64■□□□□ 0.25
UBE2E3-201ENST00000392415 NHLRC3Q5JS37 347 aa16.64■□□□□ 0.25
UBE2E3-201ENST00000392415 C6orf141Q5SZD1 244 aa16.64■□□□□ 0.25
UBE2E3-201ENST00000392415 RNLSQ5VYX0 342 aa16.64■□□□□ 0.25
UBE2E3-201ENST00000392415 BRICD5Q6PL45 260 aa16.64■□□□□ 0.25
UBE2E3-201ENST00000392415 LIAT1Q6ZQX7 453 aa16.64■□□□□ 0.25
UBE2E3-201ENST00000392415 OR14A2Q96R54 314 aa16.64■□□□□ 0.25
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
UBE2E3-201ENST00000392415 METTL9Q9H1A3 318 aa16.64■□□□□ 0.25
UBE2E3-201ENST00000392415 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
UBE2E3-201ENST00000392415 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa16.64■□□□□ 0.25
UBE2E3-201ENST00000392415 OR6C3Q9NZP0 311 aa16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms