RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383974.1

RNU6-1040P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1040, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1040P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1040P-201ENST00000383974 USH1CQ9Y6N9 552 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RTTNQ86VV8 2226 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MYOFQ9NZM1 2061 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1040P-201ENST00000383974 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SLC5A10A0PJK1 596 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CD300LBA8K4G0 201 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 A8MWP6 167 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 C1QCP02747 245 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CCR7P32248 378 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 EVI2BP34910 448 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SPAM1P38567 509 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PAFAH1B2P68402 229 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 APOFQ13790 326 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR8G1Q15617 311 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 C5orf64Q2M2E5 130 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 APRG1Q8IVJ8 170 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 KIF2BQ8N4N8 673 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR4C5Q8NGB2 326 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR5T3Q8NGG3 340 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 AKR7LQ8NHP1 331 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 C22orf15Q8WYQ4 148 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 Q96M85 177 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 METTL26Q96S19 204 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TAPBPLQ9BX59 468 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PECRQ9BY49 303 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ULBP1Q9BZM6 244 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TMCC3Q9ULS5 477 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NINLQ9Y2I6 1382 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 HACD1B0YJ81 288 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CACNG3O60359 315 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GCGP01275 180 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CRYGDP07320 174 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SKP2Q13309 424 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GPR176Q14439 515 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GLYATQ6IB77 296 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SDIM1Q6ZPB5 146 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GALNT10Q86SR1 603 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GABRG1Q8N1C3 465 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR6K3Q8NGY3 331 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NDNFQ8TB73 568 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CPB2Q96IY4 423 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GLT1D1Q96MS3 346 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ANAPC13Q9BS18 74 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CD209Q9NNX6 404 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FLVCR2Q9UPI3 526 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 AP3M1Q9Y2T2 418 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DISP1Q96F81 1524 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 H0Y8G0 127 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DFFAO00273 331 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PLA2G10O15496 165 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TAC1P20366 129 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SULT1E1P49888 294 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RAP1GDS1P52306 607 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MMDQ15546 238 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 Q499Y3 187 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 AGTRAPQ6RW13 159 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ZFAND1Q8TCF1 268 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CD200R1Q8TD46 325 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 KCTD4Q8WVF5 259 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TWIST2Q8WVJ9 160 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RASD2Q96D21 266 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SLC35G5Q96KT7 338 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TBC1D24Q9ULP9 559 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TFR2Q9UP52 801 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TNIKQ9UKE5 1360 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FREM1Q5H8C1 2179 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FRAS1Q86XX4 4008 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR2AT4A6NND4 320 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SOD1P00441 154 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RLN2P04090 185 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CECR9P0C854 216 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RALBP11234 206 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LPAR6P43657 344 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RELAQ04206 551 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ANKDD1AQ495B1 522 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SPATA8Q6RVD6 105 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CCDC121Q6ZUS5 278 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ZNF283Q8N7M2 679 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NT5CQ8TCD5 201 aa-0.32□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms