RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 C17orf64Q86WR6 236 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC38A9Q8NBW4 561 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TWIST2Q8WVJ9 160 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 C16orf70Q9BSU1 422 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 CLCF1Q9UBD9 225 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 FTCDNL1E5RQL4 147 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SYNGR4O95473 234 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TACR1P25103 407 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 NPY1RP25929 384 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ID3Q02535 119 aa5.9□□□□□ -1.46
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RABGEF1-202ENST00000380828 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 CDC20BQ86Y33 519 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 VN1R17PQ8TDU5 208 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ZDHHC16Q969W1 377 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 MACROD1Q9BQ69 325 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 OR51I1Q9H343 314 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SH2D2AQ9NP31 389 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 PLAGL1Q9UM63 463 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 V9GYY9 64 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 URB1O60287 2271 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SHISA3A0PJX4 238 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4C45A6NMZ5 311 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLC2P0DOY2 106 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLC3P0DOY3 106 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 LPAR6P43657 344 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 CATR1Q13166 79 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 C4orf26Q17RF5 130 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC10Q5BKY1 277 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 CT83Q5H943 113 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 UFSP1Q6NVU6 142 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNRGQ8N5I3 272 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 NOXO1Q8NFA2 376 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 A4GALTQ9NPC4 353 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 CLN6Q9NWW5 311 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 HS3ST2Q9Y278 367 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 INSIG2Q9Y5U4 225 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF860A6NHJ4 632 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 FCGR2AP12318 317 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 CLDN15P56746 228 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 INSL4Q14641 139 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM78Q5T7P6 136 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM215Q68D42 235 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A26Q70HW3 274 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 CALHM3Q86XJ0 350 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 OR52R1Q8NGF1 315 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 ACER1Q8TDN7 264 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM131CQ96AQ9 280 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 PCED1BQ96HM7 432 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 MS4A10Q96PG2 267 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 HRASLS2Q9NWW9 162 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 RAI2Q9Y5P3 530 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 NUPR1O60356 82 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM50AO95807 157 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 IFNW1P05000 195 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 IGFBP2P18065 325 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 TSPOP30536 169 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 RHOBP62745 196 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS25P62851 125 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 GNG5P63218 68 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 C1QL3Q5VWW1 255 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF175Q8N4F7 328 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 OR1L8Q8NGR8 309 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 RLIMQ9NVW2 624 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 FUT9Q9Y231 359 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF222A6NCQ9 220 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 REG1AP05451 166 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 CTRLP40313 264 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 TAF6P49848 677 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB10P61026 200 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 TECRLQ5HYJ1 363 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 MSRB3Q8IXL7 192 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 TDHQ8IZJ6 230 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 CA13Q8N1Q1 262 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5K2Q8NHB8 316 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF681Q96N22 645 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 OXGR1Q96P68 337 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 ATOH8Q96SQ7 321 aa5.89□□□□□ -1.47
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