RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 RBM11P57052 281 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
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PGGT1B-202ENST00000379615 EDDM3AQ14507 147 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 MPV17LQ2QL34 196 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 C1orf100Q5SVJ3 147 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 VMO1Q7Z5L0 202 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 LYPD6Q86Y78 171 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 TSPAN14Q8NG11 270 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 OR4S1Q8NGB4 309 aa12.66□□□□□ -0.38
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PGGT1B-202ENST00000379615 CST11Q9H112 138 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF69Q9UC07 566 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 COL6A5A8TX70 2615 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa12.65□□□□□ -0.38
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PGGT1B-202ENST00000379615 MYL9P24844 172 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 P2RX3P56373 397 aa12.65□□□□□ -0.38
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PGGT1B-202ENST00000379615 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 C9orf139Q6ZV77 190 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 USP43Q70EL4 1123 aa12.65□□□□□ -0.38
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR6M1Q8NGM8 313 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 LHX4Q969G2 390 aa12.65□□□□□ -0.38
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF728P0DKX0 622 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 CD37P11049 281 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 HTR2CP28335 458 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 NEDD8Q15843 81 aa12.64□□□□□ -0.39
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PGGT1B-202ENST00000379615 SIRT7Q9NRC8 400 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 SSR3Q9UNL2 185 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00312Q9Y6C7 94 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF212BA8MTL3 300 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC22A1O15245 554 aa12.63□□□□□ -0.39
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PGGT1B-202ENST00000379615 ERVFRD-1P60508 538 aa12.63□□□□□ -0.39
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PGGT1B-202ENST00000379615 ATAD3CQ5T2N8 411 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNG3Q8TAE7 436 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 C22orf15Q8WYQ4 148 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF714Q96N38 554 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC6A7Q99884 636 aa12.63□□□□□ -0.39
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PGGT1B-202ENST00000379615 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF696Q9H7X3 374 aa12.63□□□□□ -0.39
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PGGT1B-202ENST00000379615 STUB1Q9UNE7 303 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 V9GY05 133 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAV24A0A0B4J272 114 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 C17orf98A8MV24 154 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC17A2O00624 439 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 BPNT1O95861 308 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 UBE2E1P51965 193 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 AESQ08117 197 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF273Q14593 569 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB11BQ15907 218 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 TAF9Q16594 264 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 BRD3OSQ6XYD6 125 aa12.62□□□□□ -0.39
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