RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368226.8

PTPRK-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 6,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-207ENST00000368226 SLC17A5Q9NRA2 495 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 TMED3Q9Y3Q3 217 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 ATAD5Q96QE3 1844 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 PMCHP20382 165 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 PAX5Q02548 391 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 C1orf185Q5T7R7 199 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 FBXW9Q5XUX1 488 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 CFHR5Q9BXR6 569 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 TRDCB7Z8K6 153 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 FCARP24071 287 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 G6PCP35575 357 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 RASL11BQ9BPW5 248 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 WDR54Q9H977 334 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 STARD10Q9Y365 291 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 LIPGQ9Y5X9 500 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 PRSS23O95084 383 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 ADRA2AP08913 450 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 FABP4P15090 132 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 GGTLC2Q14390 218 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 LSMEM1Q8N8F7 131 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 OR1K1Q8NGR3 316 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 TMUB1Q9BVT8 246 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 A0A1W2PN81 502 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 OOEPA6NGQ2 149 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 GFRA3O60609 400 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 CSF2RBP32927 897 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 CHRNA7P36544 502 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 DYNLT3P51808 116 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 GPR137Q96N19 417 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 UCK1Q9HA47 277 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 CES1P1Q9UKY3 287 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 LGALS7P47929 136 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 PJVKQ0ZLH3 352 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 PLPPR5Q32ZL2 321 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 TRAT1Q6PIZ9 186 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 TMEM251Q8N6I4 163 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 NIT2Q9NQR4 276 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 PRSS50Q9UI38 385 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 LANCL1O43813 399 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 LSM6P62312 80 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 COL10A1Q03692 680 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 AANATQ16613 207 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 SLC23A3Q6PIS1 610 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 LINC00299Q6ZSB3 139 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 OR10A7Q8NGE5 316 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 SSMEM1Q8WWF3 244 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 B3GALNT1O75752 331 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 CD82P27701 267 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 GZMKP49863 264 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 C21orf58P58505 322 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF665Q9H7R5 613 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 RNF224P0DH78 156 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF154Q13106 437 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 PRSS53Q2L4Q9 553 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 CHODLQ9H9P2 273 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 RAB18Q9NP72 206 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 ALX3O95076 343 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 GP1BAP07359 652 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 GUK1Q16774 197 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 SLC25A30Q5SVS4 291 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 CDCP2Q5VXM1 449 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 TEX261Q6UWH6 196 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 FAHD2AQ96GK7 314 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 PILRBQ9UKJ0 227 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 U3KQ87 197 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 KIR2DS2P43631 304 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 EFNB2P52799 333 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 ETFRF1Q6IPR1 90 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 OR10G4Q8NGN3 311 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 OR10G9Q8NGN4 311 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 OR10G7Q8NGN6 311 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 ANXA10Q9UJ72 324 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 OR52L2PQ8NGH6 319 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 OR4S2Q8NH73 311 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 HILPDAQ9Y5L2 63 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF737O75373 536 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 ARG1P05089 322 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRK-207ENST00000368226 FBP1P09467 338 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms