RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361115.4

CCL28-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL28, Length 3,126 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28-201ENST00000361115 HAGHQ16775 308 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 OR2T2Q6IF00 324 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 DOLPP1Q86YN1 238 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 FRZBQ92765 325 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 RAB39BQ96DA2 213 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 LPAR4Q99677 370 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 NICN1Q9BSH3 213 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 DAPP1Q9UN19 280 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 PCNX3Q9H6A9 2034 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 FER1L5A0AVI2 2057 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 SPTA1P02549 2419 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 HCFC1P51610 2035 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 ADAM10O14672 748 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 CYB5BO43169 146 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 NKX2-2O95096 273 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 HLA-DQA2P01906 255 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 TRGC1P0CF51 173 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 FSTP19883 344 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 APLNRP35414 380 aa6.69□□□□□ -1.34
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CCL28-201ENST00000361115 MLF1P58340 268 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 PSG6Q00889 435 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 TNFRSF9Q07011 255 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 OR1C1Q15619 314 aa6.69□□□□□ -1.34
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CCL28-201ENST00000361115 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 RNF144BQ7Z419 303 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 APCDD1LQ8NCL9 501 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 OR52R1Q8NGF1 315 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 OR6X1Q8NH79 312 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 NT5CQ8TCD5 201 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 RAB22AQ9UL26 194 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 MED13Q9UHV7 2174 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 H3BQ15 152 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 SOX15O60248 233 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 SPARCP09486 303 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 PET100P0DJ07 73 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 SLC35A1P78382 337 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 CCL20P78556 96 aa6.69□□□□□ -1.34
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CCL28-201ENST00000361115 NNATQ16517 81 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 OPN5Q6U736 354 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 GATSQ8NAP1 163 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 ZNF524Q96C55 264 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 ARV1Q9H2C2 271 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 NELFAQ9H3P2 528 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 BCO1Q9HAY6 547 aa6.69□□□□□ -1.34
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CCL28-201ENST00000361115 RFNGQ9Y644 331 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 H0YL77 283 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 FOXS1O43638 330 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 LILRA1O75019 489 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 VSIG8P0DPA2 414 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 SERPINA2P20848 420 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 TIMP3P35625 211 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 CYB561P49447 251 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 CEBPGP53567 150 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 QRFPP83859 136 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 ANKRD37Q7Z713 158 aa6.68□□□□□ -1.34
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CCL28-201ENST00000361115 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 PTX4Q96A99 478 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 A0A0A6YYD4 124 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 A6NNC1 897 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 HRKO00198 91 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 B3GALT2O43825 422 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 CYTIPO60759 359 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL28-201ENST00000361115 NXPH2O95156 264 aa6.68□□□□□ -1.34
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