RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354749.6

TTC3-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC3, Length 9,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-201ENST00000354749 FRRS1LQ9P0K9 344 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 hADV38S2A0JD32 116 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 OR2W5A6NFC9 320 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 HERVK_113P61574 105 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 FAM219AQ8IW50 185 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 MEGF10Q96KG7 1140 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 THYN1Q9P016 225 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 GALNSP34059 522 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 LSM6P62312 80 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 IL11RAQ14626 422 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 TMEM211Q6ICI0 200 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 ZNF683Q8IZ20 524 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 GAPTQ8N292 157 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 OR1L3Q8NH93 324 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 MISP3Q96FF7 219 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 ATG101Q9BSB4 218 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 CA11O75493 328 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 PPYP01298 95 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 RPEQ96AT9 228 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 FLRT3Q9NZU0 649 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 H3BMH7 237 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 CXorf1O96002 111 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 CD226Q15762 336 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 MOB3BQ86TA1 216 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 POM121Q96HA1 1249 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 ELOVL1Q9BW60 279 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 LPAR5Q9H1C0 372 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 SLC52A3Q9NQ40 469 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 SMCHD1A6NHR9 2005 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 CORTO00230 105 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 GOSR1O95249 250 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 RIGQ13278 110 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 MRGPRX3Q96LB0 322 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 VSTM2LQ96N03 204 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 OR2W1Q9Y3N9 320 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 LIPT2A6NK58 231 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 NMBP08949 121 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 ZXDAP98168 799 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.491e-7■■□□□ 12.2
TTC3-201ENST00000354749 TUSC1Q2TAM9 212 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 TXNDC17Q9BRA2 123 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 ABCA3Q99758 1704 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 CXorf65A6NEN9 183 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 OR2T8A6NH00 312 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 MT-ND6P03923 174 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 BHLHA9Q7RTU4 235 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 ANKRD37Q7Z713 158 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 TMEM251Q8N6I4 163 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 OR11G2Q8NGC1 345 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 MRGPRDQ8TDS7 321 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 GPBAR1Q8TDU6 330 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 SARGQ9BW04 601 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 MSL2Q9HCI7 577 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 C5orf52A6NGY3 159 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 SHISA8B8ZZ34 492 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 F5H697 171 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 BRS3P32247 399 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 OR3A1P47881 315 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 GNB2P62879 340 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 SKP2Q13309 424 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 COL19A1Q14993 1142 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 SPNS3Q6ZMD2 512 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 SLC35E3Q7Z769 313 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 OR4B1Q8NGF8 309 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 OR1L1Q8NH94 360 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 OR6C3Q9NZP0 311 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 PRNDQ9UKY0 176 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 KIF13BQ9NQT8 1826 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 MYOGP15173 224 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 SRP14P37108 136 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 PAFAH1B2P68402 229 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 MPV17LQ2QL34 196 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 ZNF547Q8IVP9 402 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 RFESDQ8TAC1 157 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 OOEPA6NGQ2 149 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 ZNF716A6NP11 495 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 DIRC3C9JPN6 131 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 K7ESF4 209 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 APCSP02743 223 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC3-201ENST00000354749 MMP16P51512 607 aa5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms