RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 MSTNO14793 375 aa14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 CD55P08174 381 aa14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 MMP9P14780 707 aa14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 GABRR1P24046 479 aa14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 CMTM1Q8IZ96 169 aa14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 COPS7AQ9UBW8 275 aa14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 A6NNC1 897 aa14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 EPHA1P21709 976 aa14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 KISS1Q15726 138 aa14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 SLC25A45Q8N413 288 aa14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 LRTM2Q8N967 370 aa14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 OR4D5Q8NGN0 318 aa14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 OR5C1Q8NGR4 320 aa14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 DNASE2BQ8WZ79 361 aa14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 EMC6Q9BV81 110 aa14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 SLC2A9Q9NRM0 540 aa14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.6□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 MS4A18H0YCH9 400 aa14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 DUX1O43812 170 aa14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 TSPAN2O60636 221 aa14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 MS4A18Q3C1V0 323 aa14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 LGI3Q8N145 548 aa14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 NOXO1Q8NFA2 376 aa14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 SSC4DQ8WTU2 575 aa14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 GLRX2Q9NS18 164 aa14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 FGF21Q9NSA1 209 aa14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 ZNF850A8MQ14 1090 aa14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 OPRM1P35372 400 aa14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 RRADP55042 308 aa14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 PMS2P11Q13670 270 aa14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 SLC25A26Q70HW3 274 aa14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 PLXDC1Q8IUK5 500 aa14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 TMEM217Q8N7C4 229 aa14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 SLC38A9Q8NBW4 561 aa14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 OR11L1Q8NGX0 322 aa14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 PI4KAP42356 2102 aa14.59□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 ZFP92A6NM28 416 aa14.58□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 CST7O76096 145 aa14.58□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 TUBG1P23258 451 aa14.58□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 ERVFC1-1P60608 527 aa14.58□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 TLE4Q04727 773 aa14.58□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 ANKRD39Q53RE8 183 aa14.58□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 CRIP3Q6Q6R5 217 aa14.58□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa14.58□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 OR5L2Q8NGL0 311 aa14.58□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.58□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 HBE1P02100 147 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 DAP3P51398 398 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 HSF1Q00613 529 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 HERPUD1Q15011 391 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 ARL6IP1Q15041 203 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 DCAF10Q5QP82 559 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 CADM4Q8NFZ8 388 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 OR10G4Q8NGN3 311 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 OR1N1Q8NGS0 311 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 VAX2Q9UIW0 290 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 ALG1L2C9J202 215 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 IQCJQ1A5X6 159 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 ZNF66Q6ZN08 573 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 D2HGDHQ8N465 521 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 TMEM252Q8N6L7 170 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 MAGT1Q9H0U3 335 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 C11orf1Q9H5F2 150 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 MOB1AQ9H8S9 216 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 SDF2L1Q9HCN8 221 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 LRFN1Q9P244 771 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 LAMP3Q9UQV4 416 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 LHFPL6Q9Y693 200 aa14.58□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 RTTNQ86VV8 2226 aa14.57□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 ZNF732B4DXR9 585 aa14.57□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 SSSCA1O60232 199 aa14.57□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 FGF5P12034 268 aa14.57□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 MPV17LQ2QL34 196 aa14.57□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 NECAP1Q8NC96 275 aa14.57□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa14.57□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa14.57□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 A0A1B0GX78 115 aa14.57□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 NKX2-6A6NCS4 301 aa14.57□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 PROB1E7EW31 1015 aa14.57□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 IFNL4K9M1U5 179 aa14.57□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 METTL15P1P0C7V9 234 aa14.57□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 DYNLT3P51808 116 aa14.57□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 CLN3Q13286 438 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms