RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 UNC119Q13432 240 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 RNFT1Q5M7Z0 435 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 TSPO2Q5TGU0 170 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 REC114Q7Z4M0 266 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 LHFPL1Q86WI0 220 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 FNDC9Q8TBE3 224 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 SPTSSAQ969W0 71 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 ISOC2Q96AB3 205 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF799Q96GE5 643 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 DEFB127Q9H1M4 99 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 SYNGR3O43761 229 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF32P17041 273 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 CRYGSP22914 178 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 LMO1P25800 156 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 ECI1P42126 302 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 C9orf152Q5JTZ5 239 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF774Q6NX45 483 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 SSX9Q7RTT3 188 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 TUSC5Q8IXB3 177 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 OR5AS1Q8N127 324 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 FDCSPQ8NFU4 85 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 OR10C1Q96KK4 312 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 KCNJ16Q9NPI9 418 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 A0A0U1RQV5 110 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM14DPA8MWL7 114 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 GPR37O15354 613 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 IGHV3-9P01782 118 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 SPINK2P20155 84 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 OR2B8PP59922 312 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF124Q15973 351 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD55Q3KP44 614 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 OR51F2Q8NH61 342 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 PRRG4Q9BZD6 226 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 LINC00470Q9BZP3 86 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 CALHM2Q9HA72 323 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 TUBD1Q9UJT1 453 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 A0A087WWC5 75 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 PATE4P0C8F1 98 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 VSIG8P0DPA2 414 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 CHATP28329 748 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 CLINT1Q14677 625 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 SLC9A3R2Q15599 337 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 MIDNQ504T8 468 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 NCMAPQ5T1S8 102 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF383Q8NA42 475 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 OR13D1Q8NGV5 346 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 OR1F12Q8NHA8 337 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 FGFBP3Q8TAT2 258 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 SLAMF9Q96A28 289 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 C14orf144Q96I85 54 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 C1orf123Q9NWV4 160 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 SPRR3Q9UBC9 169 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 FBXL17Q9UF56 701 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF724A8MTY0 619 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 DEDDO75618 318 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 OR2C1O95371 312 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 FCGR2CP31995 323 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 TAS2R60P59551 318 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 FOXC1Q12948 553 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 CLN3Q13286 438 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 SLC22A6Q4U2R8 563 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 SLC16A14Q7RTX9 510 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 AKR7LQ8NHP1 331 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 SLC7A10Q9NS82 523 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 V9GYS6 101 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 AKAP13Q12802 2813 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 CHD8Q9HCK8 2581 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 OR6C6A6NF89 314 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 SLC31A2O15432 143 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 SELLP14151 372 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 GNB3P16520 340 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 BTF3P20290 206 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 S100A10P60903 97 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 PKIAP61925 76 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 PSG4Q00888 419 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 PMP22Q01453 160 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 Q6ZSR3 168 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 RNF144BQ7Z419 303 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 BHLHE23Q8NDY6 225 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 GALNT14Q96FL9 552 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 GINS3Q9BRX5 216 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 WNT5BQ9H1J7 359 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 PRDM13Q9H4Q3 707 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 OSGIN2Q9Y236 505 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS1-204ENST00000352260 CXorf65A6NEN9 183 aa16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms