RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 OR5R1Q8NH85 324 aa7.34□□□□□ -1.23
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PKHD1-201ENST00000340994 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1W2PPC4 97 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 CYBAP13498 195 aa7.34□□□□□ -1.23
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PKHD1-201ENST00000340994 HMGA2P52926 109 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
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PKHD1-201ENST00000340994 C20orf141Q9NUB4 165 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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PKHD1-201ENST00000340994 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.34□□□□□ -1.23
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PKHD1-201ENST00000340994 CD300CQ08708 224 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 RAB33BQ9H082 229 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 HLA-DRB1P01911 266 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 PRR35P0CG20 571 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 DNLZQ5SXM8 178 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 OR2D2Q9H210 308 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 A8MWL6 223 aa7.34□□□□□ -1.23
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PKHD1-201ENST00000340994 PTGER1P34995 402 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM207Q6UWW9 146 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.34□□□□□ -1.23
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PKHD1-201ENST00000340994 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 A0A087WUJ7 227 aa7.34□□□□□ -1.24
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PKHD1-201ENST00000340994 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.34□□□□□ -1.24
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PKHD1-201ENST00000340994 CDK2AP1O14519 115 aa7.33□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 CXCL3P19876 107 aa7.33□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 CCL14Q16627 93 aa7.33□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.33□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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PKHD1-201ENST00000340994 FAM53BQ14153 422 aa7.33□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.33□□□□□ -1.24
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PKHD1-201ENST00000340994 SIGLEC7Q9Y286 467 aa7.33□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 SEMG1P04279 462 aa7.33□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 NMBP08949 121 aa7.33□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 TNFRSF1AP19438 455 aa7.33□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 NPY1RP25929 384 aa7.33□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 WNT3P56703 355 aa7.33□□□□□ -1.24
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PKHD1-201ENST00000340994 PSG11Q9UQ72 335 aa7.33□□□□□ -1.24
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PKHD1-201ENST00000340994 ZNF785A8K8V0 405 aa7.33□□□□□ -1.24
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PKHD1-201ENST00000340994 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.33□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 MRGPREQ86SM8 312 aa7.33□□□□□ -1.24
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PKHD1-201ENST00000340994 RPEQ96AT9 228 aa7.33□□□□□ -1.24
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PKHD1-201ENST00000340994 IL19Q9UHD0 177 aa7.33□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 DHRS7CA6NNS2 312 aa7.33□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 FAHP16930 419 aa7.33□□□□□ -1.24
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PKHD1-201ENST00000340994 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 CALHM1Q8IU99 346 aa7.33□□□□□ -1.24
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