RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
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GINS3-202ENST00000328514 GPR87Q9BY21 358 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 SRD5A3Q9H8P0 318 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 CALHM2Q9HA72 323 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 ZNF160Q9HCG1 818 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 GLRX2Q9NS18 164 aa9.77□□□□□ -0.85
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GINS3-202ENST00000328514 RFNGQ9Y644 331 aa9.77□□□□□ -0.85
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GINS3-202ENST00000328514 H3BML4 177 aa9.76□□□□□ -0.85
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GINS3-202ENST00000328514 THEGLP0DJG4 465 aa9.76□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 OPRM1P35372 400 aa9.76□□□□□ -0.85
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GINS3-202ENST00000328514 ASCL1P50553 236 aa9.76□□□□□ -0.85
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GINS3-202ENST00000328514 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
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GINS3-202ENST00000328514 TMEM240Q5SV17 173 aa9.76□□□□□ -0.85
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GINS3-202ENST00000328514 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.76□□□□□ -0.85
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GINS3-202ENST00000328514 ZNF286AQ9HBT8 521 aa9.76□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 SDF2L1Q9HCN8 221 aa9.76□□□□□ -0.85
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GINS3-202ENST00000328514 FUT3P21217 361 aa9.76□□□□□ -0.85
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GINS3-202ENST00000328514 FBXW4P57775 412 aa9.76□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 CHAF1BQ13112 559 aa9.76□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 C10orf128Q5T292 105 aa9.76□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 TMEM211Q6ICI0 200 aa9.76□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 Q6ZS49 121 aa9.76□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 SLC25A26Q70HW3 274 aa9.76□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa9.76□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 OR10A7Q8NGE5 316 aa9.76□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 OR11L1Q8NGX0 322 aa9.76□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 OR4X1Q8NH49 305 aa9.76□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 POC1BQ8TC44 478 aa9.76□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.76□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 PIGTQ969N2 578 aa9.76□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa9.76□□□□□ -0.85
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GINS3-202ENST00000328514 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa9.76□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 THADAQ6YHU6 1953 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 PIAS2O75928 621 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 BCL2P10415 239 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 EPHA1P21709 976 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 MSR1P21757 451 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 FBLP22087 321 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 CTHP32929 405 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 NPBWR2P48146 333 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 VAMP2P63027 116 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 NMSQ5H8A3 153 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 DMRTC1Q5HYR2 192 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 CARFQ8N187 725 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 SNX22Q96L94 193 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 CABLES2Q9BTV7 478 aa9.75□□□□□ -0.85
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GINS3-202ENST00000328514 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 DFFBO76075 338 aa9.74□□□□□ -0.85
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GINS3-202ENST00000328514 IL18BPO95998 194 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 PPYP01298 95 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 AADACP22760 399 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 UCP1P25874 307 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 HERV-K104P61576 105 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 IL22RA1Q8N6P7 574 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 OR1P1Q8NH06 330 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 IL22RA2Q969J5 263 aa9.74□□□□□ -0.85
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