RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 LIMS2Q7Z4I7 341 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 CADM4Q8NFZ8 388 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 FAM131CQ96AQ9 280 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 A0A087WWC5 75 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 TCL1AP56279 114 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 H2BFSP57053 126 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 ERASQ7Z444 233 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 EGLN1Q9GZT9 426 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 FAM234AQ9H0X4 552 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 JKAMPQ9P055 326 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 CES1P1Q9UKY3 287 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 AUP1Q9Y679 476 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 SCGB1D4Q6XE38 83 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 OR13G1Q8NGZ3 307 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 FRG2CA6NGY1 282 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 RHOBP62745 196 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 SSX8Q7RTT4 187 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 PBOV1Q9GZY1 135 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 DPRXA6NFQ7 191 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 PITX3O75364 302 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 CD74P04233 296 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 LTC4SQ16873 150 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 D2HGDHQ8N465 521 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 TBC1D29Q9UFV1 150 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 OR51B4Q9Y5P0 310 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 OR2M5A3KFT3 312 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 SMAGPQ0VAQ4 97 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 DUSP5Q16690 384 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 LRRC18Q8N456 261 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 SARAFQ96BY9 339 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 LPAL2Q16609 132 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 OR6X1Q8NH79 312 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 RTL8AQ9BWD3 113 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 SAP30LQ9HAJ7 183 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 GPR84Q9NQS5 396 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 SPINT2O43291 252 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 PAGE4O60829 102 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 OR2J3O76001 311 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 SMIM13P0DJ93 91 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 EDDM3BP56851 147 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 CA13Q8N1Q1 262 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 OR10G3Q8NGC4 313 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 DOCK2Q92608 1830 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 CSN3P07498 182 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 NMUP48645 174 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 HIKESHIQ53FT3 197 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 GVQW1Q8N7I0 195 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 C4orf45Q96LM5 186 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 VSIG4Q9Y279 399 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 FUT7Q11130 342 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 OR1C1Q15619 314 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 RTL8BQ17RB0 113 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 S1PR5Q9H228 398 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 KCNK15Q9H427 330 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 PAPPAQ13219 1627 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1W2PR48 441 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 FAM221AA4D161 298 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 HLA-DQA1P01909 254 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 LIAT1Q6ZQX7 453 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 CXCL16Q9H2A7 254 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 SPCS1Q9Y6A9 102 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 OR4C45A6NMZ5 311 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 OR1D5P58170 312 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 OR8B3Q8NGG8 313 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 TAAR6Q96RI8 345 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 SLC25A1P53007 311 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 AGERQ15109 404 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1W2PRS3 328 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRO-201ENST00000281171 LIPFP07098 398 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRO-201ENST00000281171 GCSHP23434 173 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRO-201ENST00000281171 RND3P61587 244 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF750Q32MQ0 723 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRO-201ENST00000281171 WDR38Q5JTN6 314 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRO-201ENST00000281171 BCORP1Q8N888 145 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRO-201ENST00000281171 SLC26A1Q9H2B4 701 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRO-201ENST00000281171 HES4Q9HCC6 221 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRO-201ENST00000281171 PRRT4C9JH25 899 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRO-201ENST00000281171 LDLRAD4O15165 306 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRO-201ENST00000281171 SMPD2O60906 423 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRO-201ENST00000281171 RAC1P63000 192 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRO-201ENST00000281171 CD226Q15762 336 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRO-201ENST00000281171 OTOSQ8NHW6 89 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRO-201ENST00000281171 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRO-201ENST00000281171 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms