RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 GCNT2Q8N0V5 402 aa14.99□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 TRIB1Q96RU8 372 aa14.99□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 GFI1Q99684 422 aa14.99□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 AUP1Q9Y679 476 aa14.99□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 LNP1A1A4G5 178 aa14.99□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 PRSS12P56730 875 aa14.99□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 MUCL1Q96DR8 90 aa14.99□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 C17orf112F2Z3M2 114 aa14.99□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 ADAM11O75078 769 aa14.99□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 P2RY1P47900 373 aa14.99□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 FAM173AQ9BQD7 235 aa14.99□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.99□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa14.99□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 METTL15P1P0C7V9 234 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 ERVK-16P61578 105 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 CLN3Q13286 438 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 OR13G1Q8NGZ3 307 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 GUCD1Q96NT3 240 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 C5orf66Q9H5L9 145 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 PGA3P0DJD8 388 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 TLE1Q04724 770 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 LIAT1Q6ZQX7 453 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 OR5AS1Q8N127 324 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 SLC2A8Q9NY64 477 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 PSENENQ9NZ42 101 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 MLF1P58340 268 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 PMP22Q01453 160 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 NHLH2Q02577 135 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 KCNE4Q8WWG9 221 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 RRP8O43159 456 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 UBE2V2Q15819 145 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 WDR13Q9H1Z4 485 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 LINC00469Q8N7U9 141 aa14.97□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 OR10D3Q8NH80 312 aa14.97□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 SLC2A9Q9NRM0 540 aa14.97□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa14.97□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1W2PQD3 144 aa14.97□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 PRR32B1ATL7 298 aa14.97□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 SNCAP37840 140 aa14.97□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa14.97□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 EXTL1Q92935 676 aa14.97□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 AKAP6Q13023 2319 aa14.97□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 CACNA1DQ01668 2161 aa14.97□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 C5orf49A4QMS7 147 aa14.97□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 OR5H15A6NDH6 313 aa14.97□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 AP1S3Q96PC3 154 aa14.97□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 UCN2Q96RP3 112 aa14.97□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 HKR1P10072 659 aa14.96□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 TXN2Q99757 166 aa14.96□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 ADAM19Q9H013 955 aa14.96□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa14.96□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF320A2RRD8 509 aa14.96□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 OR5H1A6NKK0 313 aa14.96□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 ATP6V0CP27449 155 aa14.96□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 C3AR1Q16581 482 aa14.96□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 MESP1Q9BRJ9 268 aa14.96□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa14.96□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa14.96□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 XKRY2A2RUG3 117 aa14.96□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 DXOO77932 396 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 RAC1P63000 192 aa14.96□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF766Q5HY98 468 aa14.96□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 FDX2Q6P4F2 183 aa14.96□□□□□ -0.01
TRPC1-201ENST00000273482 DOCK7Q96N67 2140 aa14.96□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 RPP30P78346 268 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ETV3LQ6ZN32 361 aa14.96□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.96□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 HAAOP46952 286 aa14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MEOX1P50221 254 aa14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 FGF11Q92914 225 aa14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 POM121Q96HA1 1249 aa14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SPSB2Q99619 263 aa14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 FRMPD3Q5JV73 1810 aa14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 TSPAN2O60636 221 aa14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 LTC4SQ16873 150 aa14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 FOXB1Q99853 325 aa14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 WDR54Q9H977 334 aa14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SLC22A20A6NK97 555 aa14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MBP02144 154 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms