RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 DNASE2BQ8WZ79 361 aa9.48□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 TM4SF19Q96DZ7 209 aa9.48□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 HIST1H2BLQ99880 126 aa9.48□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 PCNX3Q9H6A9 2034 aa9.48□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 METTL7AQ9H8H3 244 aa9.48□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 WISP1O95388 367 aa9.48□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 PGA3P0DJD8 388 aa9.48□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF728P0DKX0 622 aa9.48□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 CDAP32320 146 aa9.48□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 TAF9Q16594 264 aa9.48□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 DCAF12Q5T6F0 453 aa9.48□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 OR52M1Q8NGK5 317 aa9.48□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 PTX4Q96A99 478 aa9.48□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 CHST11Q9NPF2 352 aa9.48□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 KLK10O43240 276 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 SSSCA1O60232 199 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 GFRA3O60609 400 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 FCGR2AP12318 317 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 GABREP78334 506 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 PLCXD2Q0VAA5 305 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 SGCBQ16585 318 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF66Q6ZN08 573 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 C1QL4Q86Z23 238 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 FAM185AQ8N0U4 392 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 M1APQ8TC57 530 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 ABHD5Q8WTS1 349 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 C11orf40Q8WZ69 217 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 DFFBO76075 338 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 CD200P41217 278 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 BIDP55957 195 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 HLA-DRB3P79483 266 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 SLC10A1Q14973 349 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 PDCD1Q15116 288 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 MPV17LQ2QL34 196 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 SLC35G3Q8N808 338 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 PGAM5Q96HS1 289 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 RTN4RQ9BZR6 473 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 XKRY2A2RUG3 117 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 MT-CO3P00414 261 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 THBS4P35443 961 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 PMS2P11Q13670 270 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 LGI3Q8N145 548 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 ATMQ13315 3056 aa9.47□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa9.46□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 DHRS7CA6NNS2 312 aa9.46□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM14DPA8MWL7 114 aa9.46□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 CLDN34H7C241 214 aa9.46□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 ANGPTL7O43827 346 aa9.46□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 COX5BP10606 129 aa9.46□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 FUT3P21217 361 aa9.46□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 GNRHRP30968 328 aa9.46□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 ERVS71-1P61550 626 aa9.46□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 HERV-K104P61576 105 aa9.46□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 FOXO1Q12778 655 aa9.46□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF266Q14584 549 aa9.46□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 OR5C1Q8NGR4 320 aa9.46□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 GPHA2Q96T91 129 aa9.46□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 PARD6AQ9NPB6 346 aa9.46□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 CBY1Q9Y3M2 126 aa9.46□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 AKAP13Q12802 2813 aa9.46□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 A0A1W2PPQ1 181 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 A6NCN8 305 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 BGLAPP02818 100 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 EPHA1P21709 976 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 C1QL2Q7Z5L3 287 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 OR11L1Q8NGX0 322 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 DYRK2Q92630 601 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 ADAM19Q9H013 955 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 FER1L5A0AVI2 2057 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 CEBPZOSA8MTT3 80 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 HPNP05981 417 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 DUSP1P28562 367 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 GPR3P46089 330 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 MLF1P58340 268 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 SHBQ15464 509 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 WDR5BQ86VZ2 330 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 WWTR1Q9GZV5 400 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 OSGIN2Q9Y236 505 aa9.46□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 USF3Q68DE3 2245 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 OBSL1O75147 1896 aa9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms