RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 RAD51DO75771 328 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFSF13O75888 250 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 FARS2O95363 451 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 HKR1P10072 659 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 RBMXP38159 391 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 P2RY4P51582 365 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 SNU13P55769 128 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 VWA1Q6PCB0 445 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 WDFY1Q8IWB7 410 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR84Q9NQS5 396 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 ALPK2Q86TB3 2170 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 PKDREJQ9NTG1 2253 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 C19orf84I3L1E1 186 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 PGA4P0DJD7 388 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 PGA3P0DJD8 388 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CTSSP25774 331 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 LPAR6P43657 344 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 SULT4A1Q9BR01 284 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHA2Q9HB19 425 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 EHFQ9NZC4 300 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 B3GAT1Q9P2W7 334 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNGR4O95473 234 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CLDN14O95500 239 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 NR2C1P13056 603 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 SWI5Q1ZZU3 235 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 TM2D1Q9BX74 207 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 BANF2Q9H503 90 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 TUBA4BQ9H853 241 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 K7EPK0 472 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL12P30050 165 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CHRFAM7AQ494W8 412 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 OR51T1Q8NGJ9 327 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6X1Q8NH79 312 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM96BQ9Y3D0 163 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 HCFC1P51610 2035 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 IFNA21P01568 189 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM6P0DI80 62 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 NAT2P11245 290 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 S100A10P60903 97 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 GUSBP1Q15486 140 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 OR51F2Q8NH61 342 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 KIRREL1Q96J84 757 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf196B1AJZ1 125 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 F12P00748 615 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 AGAP20933 346 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 PTAFRP25105 342 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 THBS4P35443 961 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC16A14Q7RTX9 510 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 UBAC2Q8NBM4 344 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 STARD4Q96DR4 205 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 EMC6Q9BV81 110 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 DEDDO75618 318 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 GLRA1P23415 457 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 PMELP40967 661 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 PTGFRP43088 359 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 TFF3Q07654 80 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 SGPP2Q8IWX5 399 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 TUSC5Q8IXB3 177 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 OR14K1Q8NGZ2 314 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 C10orf35Q96D05 121 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 GSKIPQ9P0R6 139 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM157AC9JC47 383 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CPT2P23786 658 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 H3F3AP84243 136 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 RTN4RL2Q86UN3 420 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 SPACA5Q96QH8 159 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 PECRQ9BY49 303 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 DECR2Q9NUI1 292 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 EDARQ9UNE0 448 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 NFYBP25208 207 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 BHLHE23Q8NDY6 225 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 PP6455Q8WZ26 134 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 TCEAL7Q9BRU2 100 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 CACFD1Q9UGQ2 172 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV3-1P01715 115 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 MT-ND4LP03901 98 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 SFTPBP07988 381 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXB5P09067 269 aa22.63■■□□□ 1.21
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