RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 MXRA5Q9NR99 2828 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 CD300LBA8K4G0 201 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 DISC1C4P0D8 188 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 AKR7A2O43488 359 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 HTR3BO95264 441 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 CSTBP04080 98 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 VSIG10L2P0DP72 767 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 CEACAM21Q3KPI0 293 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF626Q68DY1 528 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 OR52W1Q6IF63 320 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 IDO2Q6ZQW0 420 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 LRP11Q86VZ4 500 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 HPSE2Q8WWQ2 592 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 PRRT1Q99946 306 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 SEC22CQ9BRL7 303 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 YAE1D1Q9NRH1 226 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 MEIKINA0A087WXM9 373 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 SSNA1O43805 119 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 CXCL3P19876 107 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 GZMKP49863 264 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 Q8NFD4 153 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 OR13C8Q8NGS7 320 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 CYYR1Q96J86 154 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 HSF4Q9ULV5 492 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 NPTNQ9Y639 398 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 PLATP00750 562 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 ANXA3P12429 323 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 HRH1P35367 487 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 ARFRP1Q13795 201 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 ACTBL2Q562R1 376 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 SIGIRRQ6IA17 410 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 FBXW12Q6X9E4 464 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 CALHM1Q8IU99 346 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 SAXO1Q8IYX7 474 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 FZR1Q9UM11 496 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 COL6A5A8TX70 2615 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 RLN1P04808 185 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 USF1P22415 310 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 ERP29P30040 261 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 GLRXP35754 106 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 PDLIM4P50479 330 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 VAX1Q5SQQ9 334 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 HOGA1Q86XE5 327 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 OSR2Q8N2R0 312 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 SPICQ8N5J4 248 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 OR5A2Q8NGI9 324 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 OR51F2Q8NH61 342 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 MPC1Q9Y5U8 109 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM82A0PJX8 343 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 IGHV4-31P0DP07 118 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 GABRR1P24046 479 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 NKPD1Q17RQ9 610 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 OR4K15Q8NH41 348 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 MRGPRFQ96AM1 343 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 SYT3Q9BQG1 590 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 RAB1BQ9H0U4 201 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 CDH20Q9HBT6 801 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF222Q9UK12 451 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 SFTPBP07988 381 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 CHATP28329 748 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 MICBQ29980 383 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 C6orf201Q7Z4U5 140 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 OR5P3Q8WZ94 311 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 MDFIQ99750 246 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF69Q9UC07 566 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 LYNX1G3V0Z9 82 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FABP7O15540 132 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 CSN2P05814 226 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 LYNX1P0DP58 116 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 DAOP14920 347 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 ERVS71-1P61550 626 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 PPP1CBP62140 327 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 TAF9Q16594 264 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 ELP2Q6IA86 826 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 SLC25A26Q70HW3 274 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 ARRDC1Q8N5I2 433 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 ZDHHC22Q8N966 263 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 OR52B4Q8NGK2 314 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC107Q8WV48 283 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms