RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 CTLA4P16410 223 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 FAM214BQ7L5A3 538 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 OR1L8Q8NGR8 309 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 FAM222BQ8WU58 562 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 PRSS1P07477 247 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 CT62P0C5K7 136 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 RNF224P0DH78 156 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 GABRB1P18505 474 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 GFRA1P56159 465 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 AMER3Q8N944 861 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 IL22RA2Q969J5 263 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 FAM24AA6NFZ4 105 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 EVX1P49640 407 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 RAB9AP51151 201 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 HMGCLL1Q8TB92 370 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 ASB13Q8WXK3 278 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF714Q96N38 554 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 TGIF2Q9GZN2 237 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 BMPR1BO00238 502 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 FABP4P15090 132 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 YBX1P67809 324 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 TM4SF20Q53R12 229 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 MZB1Q8WU39 189 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 NAA60Q9H7X0 242 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 NUP98P52948 1817 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 SPINK4O60575 86 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 LYRM7Q5U5X0 104 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 ZDHHC22Q8N966 263 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 OR8B12Q8NGG6 310 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 OR52M1Q8NGK5 317 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 KLK11Q9UBX7 282 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 PAPPAQ13219 1627 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 CACNA1GO43497 2377 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 A0A0B4J293 547 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 HLA-GP17693 338 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 BCL3P20749 454 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 Q6ZN92 141 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 SCN11AQ9UI33 1791 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 REG1BP48304 166 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 OR5C1Q8NGR4 320 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 LILRB4Q8NHJ6 448 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 GSX2Q9BZM3 304 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 HMX2A2RU54 273 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 MPZL1O95297 269 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 PSMB2P49721 201 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 DHRS11Q6UWP2 260 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 OR10G4Q8NGN3 311 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 OR10G9Q8NGN4 311 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 OR10G7Q8NGN6 311 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 OR1L6Q8NGR2 347 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 OR4X1Q8NH49 305 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 SMIM4Q8WVI0 70 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM38BQ9NVV0 291 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 WIPI2Q9Y4P8 454 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 CHST1O43916 411 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 DAOP14920 347 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 NQO2P16083 231 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 SLC6A1P30531 599 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 DLX1P56177 255 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 VAMP3Q15836 100 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 RNF212Q495C1 297 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 C10orf35Q96D05 121 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 UCN2Q96RP3 112 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 METTL26Q96S19 204 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 WDR13Q9H1Z4 485 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 WNT9BO14905 357 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 GABRA6Q16445 453 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 LY6EQ16553 131 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 TEX30Q5JUR7 227 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 SLC26A10Q8NG04 563 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 OR5A2Q8NGI9 324 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 ADIPOR1Q96A54 375 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 TIMP4Q99727 224 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-201ENST00000220888 SPTA1P02549 2419 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 TRIM77I1YAP6 450 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 CA11O75493 328 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 CAMPP49913 170 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 FAM27D1Q5T7N8 215 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 SLC23A3Q6PIS1 610 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 OR4P4Q8NGL7 312 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.1 ms