RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tsen54Q8C2A2 525 aa5.84□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r19Q8R2C7 308 aa5.84□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem205Q91XE8 189 aa5.84□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Srxn1Q9D975 136 aa5.84□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf319Q9ERR8 581 aa5.84□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sec61a2Q9JLR1 476 aa5.84□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cited4Q9WUL8 182 aa5.84□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ca14Q9WVT6 337 aa5.84□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm9573F7C950 1606 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Jbts17Q8CE72 3214 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm17655A0A1B0GT13 591 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem200bD3Z0P8 284 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P06321 130 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm9125P0DMR6 365 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Itga5P11688 1053 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Srp9P49962 86 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gmeb2P58929 530 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr85P60894 370 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dcaf7P61963 342 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rab3cP62823 227 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vax1Q2NKI2 338 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem211Q3UUA0 195 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr145Q60882 310 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ly6eQ64253 130 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 2210407C18RikQ6YI28 220 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrfn4Q80XU8 636 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spata2lQ8BNN1 426 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf768Q8R0T2 568 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r212Q8R268 357 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Naa40Q8VE10 237 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnajc24Q91ZF0 196 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sectm1aQ921W8 192 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arl4dQ99PE9 201 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf593Q9DB42 134 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bbs10Q9DBI2 713 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GlceQ9EPS3 618 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PaplnQ9EPX2 1280 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TinagQ9WUR0 475 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ChrdQ9Z0E2 948 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TpbgQ9Z0L0 426 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 B3GNT2Q9Z222 397 aa5.84□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trav6-7-dv9A0A075B639 125 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm45716A0A1B0GRQ0 93 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr239A0PK55 315 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm2026A2ART4 498 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm14444A2ARW3 426 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spink14B9EJP9 96 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gprin2D3Z1D7 455 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gstp3F6RWR5 210 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr55K7N6Q1 315 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccl4P14097 92 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Il18P70380 192 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr323Q5NCD0 323 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Csnk2a1Q60737 391 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr140Q60878 302 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sox19Q62249 55 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CstbQ62426 98 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Med25Q8VCB2 745 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 D1Ertd622eQ8VEB3 207 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr60Q8VGL4 311 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Brinp1Q920P3 760 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GltpQ9JL62 209 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 BlnkQ9QUN3 457 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr122W4VSP0 330 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Piezo2Q8CD54 2822 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm16368A0A1Y7VNG9 144 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp456B2RUK9 458 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prrt2E9PUL5 346 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm15130F6PYN5 206 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Raet1aO08602 253 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Raet1bO08603 253 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PrkacaP05132 351 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hoxb4P10284 250 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rps2P25444 293 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnase2P56542 353 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ElobP62869 118 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Defb4P82019 63 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nkain2Q4PNJ2 208 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ewsr1Q61545 655 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr135Q7TQP2 457 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kiaa0895lQ810A5 467 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tm2d3Q8BJ83 261 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sdhaf2Q8C6I2 164 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Las2Q8CB14 526 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cbr3Q8K354 277 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r235Q8R297 328 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snapc5Q8R2K7 98 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cuedc1Q8R3V6 388 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr51Q8VGG9 307 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cavin3Q91VJ2 260 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd209cQ91ZW9 178 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem33Q9CR67 247 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 1700029F12RikQ9CRB4 147 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Exosc8Q9D753 276 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nudt22Q9DD16 308 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r172Q9EPS4 313 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr951Q9EQ94 314 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arr3Q9EQP6 381 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ms4a4bQ9ES61 226 aa5.83□□□□□ -1.48
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prl3c1Q9QUN5 212 aa5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.6 ms