Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW9

Cd209c, CD209 antigen-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd209cQ91ZW9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Cd209cQ91ZW9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cd209cQ91ZW9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cd209cQ91ZW9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cd209cQ91ZW9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cd209cQ91ZW9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cd209cQ91ZW9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cd209cQ91ZW9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cd209cQ91ZW9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd209cQ91ZW9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cd209cQ91ZW9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cd209cQ91ZW9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cd209cQ91ZW9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cd209cQ91ZW9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Cd209cQ91ZW9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cd209cQ91ZW9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cd209cQ91ZW9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cd209cQ91ZW9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cd209cQ91ZW9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cd209cQ91ZW9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cd209cQ91ZW9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cd209cQ91ZW9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cd209cQ91ZW9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cd209cQ91ZW9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cd209cQ91ZW9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cd209cQ91ZW9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cd209cQ91ZW9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cd209cQ91ZW9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cd209cQ91ZW9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cd209cQ91ZW9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cd209cQ91ZW9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cd209cQ91ZW9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cd209cQ91ZW9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cd209cQ91ZW9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cd209cQ91ZW9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd209cQ91ZW9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd209cQ91ZW9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cd209cQ91ZW9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd209cQ91ZW9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd209cQ91ZW9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd209cQ91ZW9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd209cQ91ZW9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd209cQ91ZW9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd209cQ91ZW9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd209cQ91ZW9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cd209cQ91ZW9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cd209cQ91ZW9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cd209cQ91ZW9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cd209cQ91ZW9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd209cQ91ZW9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd209cQ91ZW9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd209cQ91ZW9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd209cQ91ZW9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd209cQ91ZW9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cd209cQ91ZW9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd209cQ91ZW9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd209cQ91ZW9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd209cQ91ZW9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd209cQ91ZW9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cd209cQ91ZW9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cd209cQ91ZW9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd209cQ91ZW9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd209cQ91ZW9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd209cQ91ZW9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd209cQ91ZW9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd209cQ91ZW9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cd209cQ91ZW9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd209cQ91ZW9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd209cQ91ZW9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd209cQ91ZW9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd209cQ91ZW9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd209cQ91ZW9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd209cQ91ZW9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd209cQ91ZW9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd209cQ91ZW9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd209cQ91ZW9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd209cQ91ZW9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd209cQ91ZW9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd209cQ91ZW9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd209cQ91ZW9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd209cQ91ZW9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd209cQ91ZW9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd209cQ91ZW9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd209cQ91ZW9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd209cQ91ZW9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd209cQ91ZW9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd209cQ91ZW9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd209cQ91ZW9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd209cQ91ZW9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd209cQ91ZW9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd209cQ91ZW9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd209cQ91ZW9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd209cQ91ZW9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd209cQ91ZW9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd209cQ91ZW9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd209cQ91ZW9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd209cQ91ZW9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd209cQ91ZW9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd209cQ91ZW9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd209cQ91ZW9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms