RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CtsbP10605 339 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 KitlgP20826 273 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fli1P26323 452 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scand1Q2M4I6 142 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Thsd4Q3UTY6 1018 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Selenbp2Q63836 472 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp790Q80ZX2 779 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arl14epQ8BIX3 276 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp286Q8C0E6 519 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc16a13Q8CE94 428 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Uqcr10Q8R1I1 64 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1497Q8VG11 314 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il24Q925S4 181 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PsphQ99LS3 225 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tex12Q9CR81 123 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eef1akmt1Q9CY45 214 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Emc4Q9CZX9 183 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Alkbh7Q9D6Z0 221 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MtfmtQ9D799 386 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700020A23RikQ9DA59 131 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01746 140 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fabp2P55050 132 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AccslQ3UX83 580 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrfn4Q80XU8 636 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adprhl1Q8BGK2 353 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fndc9Q8BJN4 226 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RhofQ8BYP3 211 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sav1Q8VEB2 386 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr995Q8VF74 315 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpinb1bQ8VHP7 382 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cacng5Q8VHW4 275 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MallQ91X49 154 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp61Q923D1 555 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem42Q9CR22 157 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cmtm2aQ9DAR1 169 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sec61a2Q9JLR1 476 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spg11Q3UHA3 2430 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dcaf10A2AKB9 566 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r174E9PYW5 313 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc17a3G3UWD9 498 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm4778L7N229 365 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01800 113 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PipP02816 146 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cox5aP12787 146 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bmp8bP55105 399 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm773Q3TML4 206 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prss43Q76HL1 382 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ClmQ7TSN2 230 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r231Q8R2A3 311 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr168Q8VF05 312 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lpcat3Q91V01 487 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PccbQ99MN9 541 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 9230110F15RikQ9D262 117 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MeiobQ9D513 470 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem225Q9D9S2 230 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr948Q9EQ95 321 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sult1b1Q9QWG7 299 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prok2Q9QXU7 128 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif2s3yQ9Z0N2 472 aa11.13□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21117A0A087WPJ9 222 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm20820A0A087WPP3 222 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm20937A0A087WQA3 222 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21258A0A087WQC7 222 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21095A0A087WR14 222 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm20824A0A087WS97 222 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm29866A0A0A6YX04 222 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1289A0A288CFY5 326 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnaset2aC0HKG5 259 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnaset2bC0HKG6 259 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ceacam16E9QA28 426 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp977L7N2E7 438 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bet1O35623 118 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klk1b3P00756 261 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zdhhc8Q5Y5T5 762 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pafah1b3Q61205 232 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1211Q7TR09 311 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GldnQ8BMF8 549 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MetrnQ8C1Q4 291 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd300eQ8K249 196 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbm48Q8K2X2 371 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crtac1Q8R555 646 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1254Q8VFB1 314 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl28Q9D1B9 257 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dmrtc1c1Q9D410 238 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpx2Q9JHC0 190 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TsnaxQ9QZE7 290 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r5B2RQT2 315 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp988F6VKC7 633 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gfi1bO70237 330 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcstv3O70518 169 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nme1P15532 152 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Capza1P47753 286 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl8P59280 629 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cfap161Q6P8Y0 303 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1216Q7TR05 311 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tacstd2Q8BGV3 317 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmprss7Q8BIK6 829 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defb6Q91VD6 63 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Letmd1Q924L1 360 aa11.12□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrps28Q9CY16 186 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 133 ms