RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637243.1

CHRNA4-218, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, humanhuman

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 85 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 EFNB2P52799 333 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 TMEM33P57088 247 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 ARPC4P59998 168 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 TSPAN5P62079 268 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF345Q14585 488 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 OPCMLQ14982 345 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 HIST3H3Q16695 136 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 ACTBL2Q562R1 376 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 CLVS2Q5SYC1 327 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 DCAF12L2Q5VW00 463 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 C11orf87Q6NUJ2 197 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 TMEM65Q6PI78 240 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 KLHL24Q6TFL4 600 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 PGAP1Q75T13 922 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 SERPINA12Q8IW75 414 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 SLC22A24Q8N4F4 322 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 FAM169BQ8N8A8 192 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 NOXO1Q8NFA2 376 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 BEST4Q8NFU0 473 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 OR13C3Q8NGS6 347 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 OR6X1Q8NH79 312 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 TMEM45BQ96B21 275 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 ORAI1Q96D31 301 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 SEH1LQ96EE3 360 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 MS4A3Q96HJ5 214 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 RBP7Q96R05 134 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 SYT3Q9BQG1 590 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 DYNLRB1Q9NP97 96 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 TMEM138Q9NPI0 162 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 TAS2R4Q9NYW5 299 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 GLTPQ9NZD2 209 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 B3GAT1Q9P2W7 334 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 GHRLQ9UBU3 117 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 DUX4Q9UBX2 424 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 RAB22AQ9UL26 194 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 FZR1Q9UM11 496 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 FLVCR2Q9UPI3 526 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 HYDINQ4G0P3 5121 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 A0A1B0GTI1 187 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 A0A1W2PPL8 197 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 TMEM82A0PJX8 343 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 RFPL4AA6NLU0 287 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 CEACAM18A8MTB9 384 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 DISC1C4P0D8 188 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF878C9JN71 531 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 CDC14BO60729 498 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 CA11O75493 328 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 VAMP5O95183 116 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 MPC2O95563 127 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 RAB3DO95716 219 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 CRYZL1O95825 349 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 CYB5AP00167 134 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 TTRP02766 147 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 ACSM4P0C7M7 580 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF735P0CB33 412 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 PGA4P0DJD7 388 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 PGA3P0DJD8 388 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 VSIG10L2P0DP72 767 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 NAT2P11245 290 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF35P13682 527 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 CBR1P16152 277 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 SELEP16581 610 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 FPR2P25090 351 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 S100A11P31949 105 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 TAS2R31P59538 309 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 GRB2P62993 217 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 LCN2P80188 198 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 QRFPP83859 136 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 TGFBR3Q03167 851 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 MELKQ14680 651 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 ARL6IP1Q15041 203 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 OR7A5Q15622 319 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 SPRNQ5BIV9 151 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 TOR2AQ5JU69 321 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 GLYATL3Q5SZD4 288 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 SAMD5Q5TGI4 173 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF813Q6ZN06 617 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 Q6ZSR3 168 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 UTS2BQ765I0 119 aa4.94□□□□□ -1.62
CHRNA4-218ENST00000637243 DCXRQ7Z4W1 244 aa4.94□□□□□ -1.62
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