RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A087X0M5	115 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1B0GX30	115 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4C46	A6NHA9	309 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC22	O60826	627 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	BANF1	O75531	89 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT14	P02533	472 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	CRYGC	P07315	174 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	CD1B	P29016	333 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	EMP1	P54849	157 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	UGT2B15	P54855	530 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	NAA40	Q86UY6	237 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	OPA3	Q9H6K4	179 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PPE3	182 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	NFYB	P25208	207 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	DCTD	P32321	178 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	HPCAL1	P37235	193 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	DEFA5	Q01523	94 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	SYPL1	Q16563	259 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	OTP	Q5XKR4	325 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ULK3	Q6PHR2	472 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	CCT7	Q99832	543 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	INIP	Q9NRY2	104 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR173	Q9NS66	373 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM213	A2RRL7	107 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440		H3BUA1	57 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	TSPAN4	O14817	238 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ADAP1	O75689	374 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV3-7	P01780	117 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	LAMP1	P11279	417 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC7A2	P52569	658 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	TPTE	P56180	551 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	MED21	Q13503	144 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	OXA1L	Q15070	435 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF74	Q16587	644 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	GTDC1	Q4AE62	458 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	UTF1	Q5T230	341 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	OR6V1	Q8N148	313 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	GTF2H4	Q92759	462 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	FCRL1	Q96LA6	429 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR22	Q99680	433 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF737	O75373	536 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	BCHE	P06276	602 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	CGB3	P0DN86	165 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	SERPINB5	P36952	375 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	KLC3	Q6P597	504 aa		4.12	□□□□□ -1.75

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