RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 IL22RA1Q8N6P7 574 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 OTOSQ8NHW6 89 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 CALHM2Q9HA72 323 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 FAM60AQ9NP50 221 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 DKKL1Q9UK85 242 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 C20orf202A1L168 122 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 CYR61O00622 381 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 FXYD4P59646 89 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 FOXF1Q12946 379 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 DEFB133Q30KQ1 61 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 PHLDA2Q53GA4 152 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 LCN15Q6UWW0 184 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 SYT13Q7L8C5 426 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 CA13Q8N1Q1 262 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF524Q96C55 264 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 PILRAQ9UKJ1 303 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 SHANK1Q9Y566 2161 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 SPINK2P20155 84 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 NTSR1P30989 418 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 RAB38P57729 211 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 COMMD2Q86X83 199 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 SLC26A10Q8NG04 563 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 VPS25Q9BRG1 176 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 ABHD6Q9BV23 337 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 CDH20Q9HBT6 801 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 LYRM4Q9HD34 91 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 C1orf123Q9NWV4 160 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 HHLA2Q9UM44 414 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 NKX2-2O95096 273 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 RENP00797 406 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 CHRM2P08172 466 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 SMIM10L1P0DMW3 83 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 FOLR1P15328 257 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 GPR3P46089 330 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM50BP56557 158 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 TAF9Q16594 264 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 LEMD1Q68G75 181 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 SLC16A14Q7RTX9 510 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 NUP54Q7Z3B4 507 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 LFNGQ8NES3 379 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 TM4SF19Q96DZ7 209 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 SMIM10Q96HG1 83 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 DGAT2Q96PD7 388 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 MS4A10Q96PG2 267 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 B3GAT1Q9P2W7 334 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 ANKUB1A6NFN9 424 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 SCDO00767 359 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 HLA-HP01893 362 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 GABRR1P24046 479 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 OR3A4PP47883 348 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 CARD18P57730 90 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 MGAT2Q10469 447 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 FBXW12Q6X9E4 464 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 LYG1Q8N1E2 194 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 STPG4Q8N801 248 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF321PQ8N8H1 164 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 ARV1Q9H2C2 271 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 CHD8Q9HCK8 2581 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1B0GU03 582 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1W2PNV4 684 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 SERINC4A6NH21 518 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 A8MVM7 634 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 E5RGE8 158 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 OR5AC1P0C628 307 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 SLC35E2P0CK97 266 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 CTSEP14091 401 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 OR1D4P47884 311 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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