RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 TARM1B6A8C7 271 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 IL4P05112 153 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 INHBBP09529 407 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 CLDN2P57739 230 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 GALNT14Q96FL9 552 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 HIST1H4GQ99525 98 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 GJB3O75712 270 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 CCR5P51681 352 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM33P57088 247 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ACKR1Q16570 336 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 OR51E1Q8TCB6 317 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 LANCL2Q9NS86 450 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PS18 150 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 CXorf65A6NEN9 183 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 B4GALT3O60512 393 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 MPC2O95563 127 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 OPN1LWP04000 364 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 HAAOP46952 286 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 PRO1933Q9H354 126 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 C9orf170A2RU37 121 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 MPV17LQ2QL34 196 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 BCORP1Q8N888 145 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 OR6C1Q96RD1 312 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RAB33BQ9H082 229 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 QSER1Q2KHR3 1735 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PPC1 479 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 SIRPB1O00241 398 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 GRPP07492 148 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ACVR1Q04771 509 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RAB1BQ9H0U4 201 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 CYR61O00622 381 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 STARD4Q96DR4 205 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 KLK11Q9UBX7 282 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 IFITM10A6NMD0 228 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 C11orf94C9JXX5 98 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 GFYI3L273 518 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 K7ESF4 209 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A17O43808 307 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 APCSP02743 223 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 FAM209AQ5JX71 171 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 OR52N5Q8NH56 324 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PNV4 684 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 CTDSPLO15194 276 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ADAM20O43506 726 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 NDUFB3O43676 98 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 NPBWR2P48146 333 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 LEMD1Q68G75 181 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 C5orf49A4QMS7 147 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 M0R082 166 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ACSM6Q6P461 480 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 Q7L0L9 218 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 POM121Q96HA1 1249 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 OXGR1Q96P68 337 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 SPTBN2O15020 2390 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ARSAP15289 507 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 THBS4P35443 961 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ERV3-1Q14264 604 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 LYPD8Q6UX82 237 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RBP4P02753 201 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 hADV38S2A0JD32 116 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 CD1BP29016 333 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 C12orf73Q69YU5 71 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
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