RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 FAM57BQ71RH2 274 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 SPRED2Q7Z698 418 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 OR13H1Q8NG92 308 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 HSPA12AO43301 675 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 IGHG1P01857 330 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 CRYABP02511 175 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TAS2R30P59541 319 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 PRDX4Q13162 271 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 ACY3Q96HD9 319 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 IL36GQ9NZH8 169 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 VAX2Q9UIW0 290 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 RER1O15258 196 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TK1P04183 234 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 NPBWR2P48146 333 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 ID3Q02535 119 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 MFAP5Q13361 173 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 ABCA11PQ4W5N1 156 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 NMSQ5H8A3 153 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 REEP6Q96HR9 211 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 ATP5SQ99766 215 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TGIF2Q9GZN2 237 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 METTL9Q9H1A3 318 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 VDAC3Q9Y277 283 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 RNF115Q9Y4L5 304 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 NKX2-6A6NCS4 301 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 LILRA5A6NI73 299 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 METTL12A8MUP2 240 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 GIMD1P0DJR0 217 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 BCL2P10415 239 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 FCGR2AP12318 317 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 CTSEP14091 401 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 RAB4AP20338 218 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 IL24Q13007 206 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 SLC10A1Q14973 349 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 OR10A7Q8NGE5 316 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 EMC6Q9BV81 110 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 P4HTMQ9NXG6 502 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 WNT2P09544 360 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 HOXB2P14652 356 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 FASLGP48023 281 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 DYNLT3P51808 116 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 PAX9P55771 341 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 CLRN1P58418 232 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TSPO2Q5TGU0 170 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 POC1BQ8TC44 478 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 SNX22Q96L94 193 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 A0A1B0GV50 99 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TMEM50AO95807 157 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 CCL5P13501 91 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 CDAP32320 146 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 RGS19P49795 217 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 C10orf128Q5T292 105 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 COMMD2Q86X83 199 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 OR5D18Q8NGL1 313 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 OR5L1Q8NGL2 311 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 OR11L1Q8NGX0 322 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 SPSB1Q96BD6 273 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 POM121Q96HA1 1249 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 MRGPRX1Q96LB2 322 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 CACNA1CQ13936 2221 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 MPPED1O15442 326 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 QDPRP09417 244 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 COL10A1Q03692 680 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 C17orf67Q0P5P2 114 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TRIM61Q5EBN2 209 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 UEVLDQ8IX04 471 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 OR2V1Q8NHB1 315 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 IL22RA2Q969J5 263 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 SPIN2AQ99865 258 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa8.56□□□□□ -1.04
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