RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588617.1

VMP1-208, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

TSL 4

Gene VMP1, Length 884 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-208	ENST00000588617	SSX1	Q16384	188 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	VWA8	A3KMH1	1905 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	DAPL1	A0PJW8	107 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	FAM183A	A6NL82	134 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	FFAR1	O14842	300 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	UGT2B7	P16662	529 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	LINC00596	Q86U02	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	LINC01587	Q99440	93 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	METTL9	Q9H1A3	318 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	DMAC2	Q9NW81	257 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	CFTR	P13569	1480 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	BIRC5	O15392	142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	ZW10	O43264	779 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	ADRA2A	P08913	450 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	CECR9	P0C854	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	OPRK1	P41145	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	TAS2R43	P59537	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	ORMDL3	Q8N138	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	LINC01560	Q8TB33	94 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	OR51E2	Q9H255	320 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	EEA1	Q15075	1411 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	TNS2	Q63HR2	1409 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMP1-208	ENST00000588617	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	KLLN	B2CW77	178 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617		M0QZ92	97 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	SLC16A4	O15374	487 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	GYG2	O15488	501 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	VAMP5	O95183	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	APOE	P02649	317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	MAS1	P04201	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	CBX5	P45973	191 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	CTAG1A	P78358	180 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	FAM3A	P98173	230 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	ELOC	Q15369	112 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	COX19	Q49B96	90 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	ZNF773	Q6PK81	442 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	XKRX	Q6PP77	449 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	CASP12	Q6UXS9	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	STOML3	Q8TAV4	291 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	SMIM19	Q96E16	107 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	ARL6	Q9H0F7	186 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	MAP3K5	Q99683	1374 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	CD300LB	A8K4G0	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617		H0Y980	276 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	SOX14	O95416	240 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	CA2	P00918	260 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	IL1RN	P18510	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	CEL	P19835	753 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	PYCR1	P32322	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	ACTR1B	P42025	376 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VMP1-208	ENST00000588617	ZNF235	Q14590	738 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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