RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289		A6NL46	340 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	OR2AT4	A6NND4	320 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289		A8MXK9	166 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289		H3BSH0	61 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	CYTIP	O60759	359 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SYNGR4	O95473	234 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	PLAU	P00749	431 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	IFNA2	P01563	188 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	GLA	P06280	429 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	NMB	P08949	121 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	CTXN2	P0C2S0	81 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	CCL3	P10147	92 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	LYL1	P12980	280 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ABO	P16442	354 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	GNB3	P16520	340 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	AKR1C4	P17516	323 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	TCN2	P20062	427 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	S100G	P29377	79 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	CDA	P32320	146 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ARR3	P36575	388 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	RGS19	P49795	217 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	CLDN15	P56746	228 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SRPX	P78539	464 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SORD	Q00796	357 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	PLA2G7	Q13093	441 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	PPP1R1A	Q13522	171 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	RSU1	Q15404	277 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	OR8B8	Q15620	311 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ACER2	Q5QJU3	275 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	STPG1	Q5TH74	334 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	OR10K2	Q6IF99	312 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	MOB3C	Q70IA8	216 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	STOML3	Q8TAV4	291 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ST8SIA4	Q92187	359 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	PIGT	Q969N2	578 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	NABP1	Q96AH0	204 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SGK3	Q96BR1	496 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	BORCS8	Q96FH0	119 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	C2orf50	Q96LR7	162 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	PLK3	Q9H4B4	646 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	DECR2	Q9NUI1	292 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	RASL12	Q9NYN1	266 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	KLK13	Q9UKR3	277 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF222	A6NCQ9	220 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	C17orf51	A8MQB3	221 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF724	A8MTY0	619 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM25E	A8MYX2	175 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289		F8VVB4	439 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289		F8VWA3	439 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	STMND1	H3BQB6	276 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	TNFSF11	O14788	317 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SOCS1	O15524	211 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SYNGR3	O43761	229 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SSX5	O60225	188 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	RAD51D	O75771	328 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAPPC6A	O75865	159 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SIX6	O95475	246 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ACTL6A	O96019	429 aa		3.89	□□□□□ -1.79

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