RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558285.5

USP3-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP3-208	ENST00000558285	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285		A0A1W2PPE2	198 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285		A0A1W2PR64	198 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285		A0A1W2PRV1	198 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	WNT9B	O14905	357 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	TMPRSS2	O15393	492 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	SSX5	O60225	188 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	ANXA3	P12429	323 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	ADRA2C	P18825	462 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	TGFBR1	P36897	503 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285		Q3ZCU0	254 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	FAM209B	Q5JX69	171 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	XP32	Q5T750	250 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	DDI2	Q5TDH0	399 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	HACD4	Q5VWC8	232 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	TRIQK	Q629K1	86 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	ELP2	Q6IA86	826 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	PP6455	Q8WZ26	134 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	GNG8	Q9UK08	70 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	C7orf66	A4D0T2	115 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	FABP12	A6NFH5	140 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	PSMD9	O00233	223 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	SCGB1D2	O95969	90 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	SMIM6	P0DI80	62 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	ZNF20	P17024	532 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	GLRA1	P23415	457 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	MEOX2	P50222	304 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	PPP3R1	P63098	170 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	RAB40B	Q12829	278 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	MPPED2	Q15777	294 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	GPR157	Q5UAW9	335 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	MOB3C	Q70IA8	216 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	UTS2B	Q765I0	119 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	TBX5	Q99593	518 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	OR51E2	Q9H255	320 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	BIN3	Q9NQY0	253 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	COA4	Q9NYJ1	87 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	JMJD1C	Q15652	2540 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	TMEM82	A0PJX8	343 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	SRRM5	B3KS81	715 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	ZNF732	B4DXR9	585 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	P2RY10	O00398	339 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	CDIPT	O14735	213 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	PLA2G10	O15496	165 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	DHFR	P00374	187 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	EPHA2	P29317	976 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	SDC2	P34741	201 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	PSMB10	P40306	273 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	GPM6A	P51674	278 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	HCCS	P53701	268 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	RAG2	P55895	527 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	IL13RA1	P78552	427 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	PDCD1	Q15116	288 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	RNLS	Q5VYX0	342 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	WDR82	Q6UXN9	313 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285		Q8IYB0	196 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	SYS1	Q8N2H4	156 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	APH1B	Q8WW43	257 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	MND1	Q9BWT6	205 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	MED28	Q9H204	178 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	DYSF	O75923	2080 aa		7.23	□□□□□ -1.25
USP3-208	ENST00000558285	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		7.23	□□□□□ -1.25

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