RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	UQCC3	Q6UW78	93 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	KCTD9	Q7L273	389 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	OR51F2	Q8NH61	342 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	SPACA5	Q96QH8	159 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	CITED4	Q96RK1	184 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	PKIB	Q9C010	78 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	GPR173	Q9NS66	373 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	TREM2	Q9NZC2	230 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	PDZD2	O15018	2839 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	TEX46	H3BTG2	121 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	OR5H8	P0DN80	308 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	S100G	P29377	79 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	MAGEA5	P43359	124 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	FGF12	P61328	243 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	RAB1A	P62820	205 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	ARG2	P78540	354 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF92	Q03936	586 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	IL13RA2	Q14627	380 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	SMCO1	Q147U7	214 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF766	Q5HY98	468 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	OR2A2	Q6IF42	318 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	MOB3C	Q70IA8	216 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	COMMD7	Q86VX2	200 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	STPG2	Q8N412	459 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	SOX7	Q9BT81	388 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	LDAH	Q9H6V9	325 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	RDH8	Q9NYR8	311 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	SPG11	Q96JI7	2443 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC22A20	A6NK97	555 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442		F8VVB4	439 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442		F8VWA3	439 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442		K7EM74	188 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	CSN2	P05814	226 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	PGAM2	P15259	253 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	ST8SIA2	Q92186	375 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	PIGC	Q92535	297 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	AQP10	Q96PS8	301 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	RASL12	Q9NYN1	266 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		10.17	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	RAB19	A4D1S5	217 aa		10.17	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		10.17	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		10.17	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		10.17	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	SIX6	O95475	246 aa		10.17	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	FCGR3A	P08637	254 aa		10.17	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	NMB	P08949	121 aa		10.17	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	WNT2	P09544	360 aa		10.17	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	ZP3	P21754	424 aa		10.17	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	GABRR1	P24046	479 aa		10.17	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	SERPINF1	P36955	418 aa		10.17	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78

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