RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545097.1

CCR3-208, Transcript of C-C motif chemokine receptor 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR3, Length 1,786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCR3-208	ENST00000545097	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	GHSR	Q92847	366 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	SMIM19	Q96E16	107 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	CHIA	Q9BZP6	476 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	KPTN	Q9Y664	436 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097		A0A1W2PQ09	198 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	TMEM89	A2RUT3	159 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097		H3BMQ9	156 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	SULT1B1	O43704	296 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	KDM4B	O94953	1096 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	CDRT1	O95170	752 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	MT-ND2	P03891	347 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	LIPF	P07098	398 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	PRTN3	P24158	256 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	ATP1B3	P54709	279 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	KRTAP10-3	P60369	221 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	EDDM3A	Q14507	147 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	IRF3	Q14653	427 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	KISS1	Q15726	138 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	TAF9	Q16594	264 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	PIGY	Q3MUY2	71 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	GPR157	Q5UAW9	335 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF773	Q6PK81	442 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097		Q6YL49	198 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	LYPD6	Q86Y78	171 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	SETD9	Q8NE22	299 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	OR52N1	Q8NH53	320 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	C10orf35	Q96D05	121 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	COQ2	Q96H96	371 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	MED30	Q96HR3	178 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	OR14A2	Q96R54	314 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	HMG20A	Q9NP66	347 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	DHDH	Q9UQ10	334 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097		A0A0A6YYJ9	748 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	FAM172BP	A6NC97	362 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	NPFF	O15130	113 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	OR2H2	O95918	312 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	CDK1	P06493	297 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	HCK	P08631	526 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	CCDC159	P0C7I6	412 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	COX7A1	P24310	79 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	FPR2	P25090	351 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	SAA4	P35542	130 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	MAP2K4	P45985	399 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	NEDD8	Q15843	81 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	AWAT1	Q58HT5	328 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF561	Q8N587	486 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	ITFG2	Q969R8	447 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	TMEM106A	Q96A25	262 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	SPSB1	Q96BD6	273 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	KCNK15	Q9H427	330 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	ING3	Q9NXR8	418 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	NOTCH1	P46531	2555 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	PTGES3L	E9PB15	166 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	HSPB6	O14558	160 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	PFDN1	O60925	122 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	SERPINA3	P01011	423 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	PRKACB	P22694	351 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	CFP	P27918	469 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	GLIPR1	P48060	266 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	ACTG1	P63261	375 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	SLC35A2	P78381	396 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF146	Q15072	292 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	OR8H2	Q8N162	312 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CCR3-208	ENST00000545097	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		6.6	□□□□□ -1.35

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