RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531842.1

USF1-210, Transcript of upstream transcription factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene USF1, Length 720 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1-210ENST00000531842 ZNF737O75373 536 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 RPP14O95059 124 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 IGLV3-1P01715 115 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 TTRP02766 147 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 ALPLP05186 524 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 LYL1P12980 280 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 DUSP1P28562 367 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 CXCR4P61073 352 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 ODF4Q2M2E3 257 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 SLC35F2Q8IXU6 374 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 ELMOD2Q8IZ81 293 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 OSR2Q8N2R0 312 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 CAPSLQ8WWF8 208 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 STMN2Q93045 179 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 ZNF714Q96N38 554 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 SLC29A1Q99808 456 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 ADI1Q9BV57 179 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 PRRG3Q9BZD7 231 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 MOB1AQ9H8S9 216 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 PLEKHA1Q9HB21 404 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 AASSQ9UDR5 926 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 SCOCQ9UIL1 159 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 SNX5Q9Y5X3 404 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 R4GMQ9 66 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 OR2F2O95006 317 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 SERPINA3P01011 423 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 IGHV3-7P01780 117 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 HTR1DP28221 377 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 OR3A4PP47883 348 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 NXNL2Q5VZ03 156 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 TMEM42Q69YG0 159 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 YIPF7Q8N8F6 280 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 OR51D1Q8NGF3 324 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 OR14K1Q8NGZ2 314 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 SLAMF9Q96A28 289 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 CEP19Q96LK0 163 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 MBOAT4Q96T53 435 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 MNTQ99583 582 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 HES4Q9HCC6 221 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 PALMDQ9NP74 551 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 HHLA2Q9UM44 414 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 SESN1Q9Y6P5 492 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.06□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 A0A1B0GTI1 187 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 hADV38S2A0JD32 116 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 J3QRE1 110 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 CCL24O00175 119 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 EI24O14681 340 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 SYT7O43581 403 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 PSPNO60542 156 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 CIB2O75838 187 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 APOL3O95236 402 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 LY86O95711 162 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 KRT8P05787 483 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 GABRB1P18505 474 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 GABRR1P24046 479 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 ATP6V1E1P36543 226 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 MYCNOSP40205 109 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 ERVK11-1P61568 191 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 IL24Q13007 206 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 HNF4GQ14541 408 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 KLHL22Q53GT1 634 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 SLC25A26Q70HW3 274 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 ZNF695Q8IW36 515 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 ABHD12Q8N2K0 398 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 Q8NFD4 153 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 EME1Q96AY2 570 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 TBX5Q99593 518 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 PKIBQ9C010 78 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 RIBC2Q9H4K1 309 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 S100A14Q9HCY8 104 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 ING3Q9NXR8 418 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 DPM3Q9P2X0 92 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 V9GYS6 101 aa7.05□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.04□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 DHRS7CA6NNS2 312 aa7.04□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 SEC14L6B5MCN3 397 aa7.04□□□□□ -1.28
USF1-210ENST00000531842 GATBO75879 557 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
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