RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 CDH26Q8IXH8 852 aa15.63■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 NKAIN3Q8N8D7 197 aa15.63■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 Q8NFD4 153 aa15.63■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 OR4M1Q8NGD0 313 aa15.63■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 LHX4Q969G2 390 aa15.63■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 IL36GQ9NZH8 169 aa15.63■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 ATRQ13535 2644 aa15.63■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SIRPB1O00241 398 aa15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 CDRT1O95170 752 aa15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 GABRR1P24046 479 aa15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 LMO1P25800 156 aa15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 BPIFB3P59826 476 aa15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 HILS1P60008 231 aa15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 RPS25P62851 125 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM27D1Q5T7N8 215 aa15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 Q6P435 159 aa15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PHC2Q8IXK0 858 aa15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SVOPQ8N4V2 548 aa15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 OR4S1Q8NGB4 309 aa15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 OR51T1Q8NGJ9 327 aa15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 OR10K1Q8NGX5 313 aa15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP1R35Q8TAP8 253 aa15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 TBC1D15Q8TC07 691 aa15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 S100A13Q99584 98 aa15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 CHST6Q9GZX3 395 aa15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 METTL9Q9H1A3 318 aa15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SIRT7Q9NRC8 400 aa15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 ING4Q9UNL4 249 aa15.62■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A1W2PPH5 198 aa15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 HTR3BO95264 441 aa15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF44P15621 663 aa15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 OR3A1P47881 315 aa15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 GP2P55259 537 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 EDDM3BP56851 147 aa15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 BLMHQ13867 455 aa15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF273Q14593 569 aa15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 IL13RA2Q14627 380 aa15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 GRK1Q15835 563 aa15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM200BQ69YZ2 307 aa15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 BRD3OSQ6XYD6 125 aa15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 CEACAM19Q7Z692 300 aa15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 LYPD6Q86Y78 171 aa15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 JAGN1Q8N5M9 183 aa15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 CHST4Q8NCG5 386 aa15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PHYHIPQ92561 330 aa15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM203Q969S6 136 aa15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 TCF7L1Q9HCS4 588 aa15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 MEGF11A6BM72 1044 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 MGST3O14880 152 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 VENTXO95231 258 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 IGHV1-69P01742 117 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 UCHL1P09936 223 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 EDDM3AQ14507 147 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 HSD17B12Q53GQ0 312 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SPARTQ8N0X7 666 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 TNFRSF14Q92956 283 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 MUL1Q969V5 352 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 JMJD8Q96S16 334 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC42Q9Y546 428 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 DEGS1O15121 323 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 CSTBP04080 98 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 CCL3L1P16619 93 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SERPINA2P20848 420 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PRTN3P24158 256 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 ERP29P30040 261 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 GABRA5P31644 462 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 DLX1P56177 255 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 GUCA2AQ02747 115 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SCN1BQ07699 218 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SSX1Q16384 188 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PIGYQ3MUY2 71 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 NHLRC3Q5JS37 347 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM91Q6ZNR0 172 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 TCF23Q7RTU1 214 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRTM1Q86UE6 522 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 OSR2Q8N2R0 312 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 UQCC2Q9BRT2 126 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PPA2Q9H2U2 334 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.3 ms