RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 CMC2Q9NRP2 79 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ACOXLQ9NUZ1 547 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 DNAJB9Q9UBS3 223 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 B9D1Q9UPM9 204 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 DYSFO75923 2080 aa3.45□□□□□ -1.86
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HDAC2-216ENST00000523628 ALPK2Q86TB3 2170 aa3.44□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 DOCK11Q5JSL3 2073 aa3.44□□□□□ -1.86
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HDAC2-216ENST00000523628 TFAP2AP05549 437 aa3.44□□□□□ -1.86
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HDAC2-216ENST00000523628 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
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HDAC2-216ENST00000523628 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
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HDAC2-216ENST00000523628 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
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HDAC2-216ENST00000523628 C10orf111Q8N326 155 aa3.44□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF561Q8N587 486 aa3.44□□□□□ -1.86
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HDAC2-216ENST00000523628 IGKV3-20P01619 116 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV1-69P01742 117 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 PATE4P0C8F1 98 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 CCL2P13500 99 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 MPV17P39210 176 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 UBE2E1P51965 193 aa3.43□□□□□ -1.86
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