RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517052.1

RNU6-448P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 448, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-448P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-448P-201ENST00000517052 HIST1H2BAQ96A08 127 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMIGD2Q96BF3 282 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 SMIM8Q96KF7 97 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 CAPZA3Q96KX2 299 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 YPEL4Q96NS1 127 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 GPR22Q99680 433 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 Q9BRP9 147 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 CRACR2AQ9BSW2 395 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 C20orf24Q9BUV8 137 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 TSSK6Q9BXA6 273 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 SPRR2GQ9BYE4 73 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 TSGA10Q9BZW7 698 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 MCUBQ9NWR8 336 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRO2289Q9P1D8 64 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC23A2Q9UGH3 650 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 BLOC1S6Q9UL45 172 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 INSIG2Q9Y5U4 225 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 SAR1BQ9Y6B6 198 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ARAP3Q8WWN8 1544 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC22A20A6NK97 555 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR2AG2A6NM03 316 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 A8MUN3 132 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 XRCC2O43543 280 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC37A4O43826 429 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 FCN3O75636 299 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 SOX14O95416 240 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 PTTG1O95997 202 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 CATP04040 527 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 IFNW1P05000 195 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 GUSBP08236 651 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 KRT16P08779 473 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 GFAPP14136 432 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 STOMP27105 288 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ELK4P28324 431 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 CRABP1P29762 137 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 HTR2BP41595 481 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 MAGEA1P43355 309 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 XKP51811 444 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 TAS2R39P59534 338 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 RPS15P62841 145 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 HTR4Q13639 388 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 GABRA6Q16445 453 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 C5orf64Q2M2E5 130 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ALKBH6Q3KRA9 238 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF404Q494X3 552 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ANKDD1AQ495B1 522 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAM229BQ4G0N7 80 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZCWPW2Q504Y3 356 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 TTC32Q5I0X7 151 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRAMEF20Q5VT98 475 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 C16orf87Q6PH81 154 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF773Q6PK81 442 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 CLEC19AQ6UXS0 136 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 VTCN1Q7Z7D3 282 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 SCD5Q86SK9 330 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 MARCH3Q86UD3 253 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 KIF2BQ8N4N8 673 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR4C5Q8NGB2 326 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR11G2Q8NGC1 345 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR13C2Q8NGS9 318 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR10Z1Q8NGY1 313 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ING5Q8WYH8 240 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 CMBLQ96DG6 245 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 TBC1D31Q96DN5 1066 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ADTRPQ96IZ2 230 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 GABRG3Q99928 467 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMED9Q9BVK6 235 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 NUP58Q9BVL2 599 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 TIMM21Q9BVV7 248 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 PKIBQ9C010 78 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ARL6Q9H0F7 186 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 PLEKHA1Q9HB21 404 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 CD209Q9NNX6 404 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 VCX3AQ9NNX9 186 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 BABAM2Q9NXR7 383 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 FBXL3Q9UKT7 428 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 C22orf24Q9Y442 160 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ASB3Q9Y575 518 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 HEY1Q9Y5J3 304 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa-0.07□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms