RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513495.5

SH3TC1-223, Transcript of SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, human

TSL 4

Gene SH3TC1, Length 600 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3TC1-223	ENST00000513495	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	TMEM104	Q8NE00	496 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	NDNF	Q8TB73	568 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	ST8SIA4	Q92187	359 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	PTX4	Q96A99	478 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	PHF21A	Q96BD5	680 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	SNX22	Q96L94	193 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	GAFA1	Q96PS6	74 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	ETV7	Q9Y603	341 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495		A0A1W2PP11	408 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	FUOM	A2VDF0	154 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495		B4DSR2	109 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	DVL1	O14640	695 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	NDUFB7	P17568	137 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	RAB6A	P20340	208 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	TAF9	Q16594	264 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	OR10K2	Q6IF99	312 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	MZT2A	Q6P582	158 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	C18orf12	Q96KH6	178 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495		Q96M66	194 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	CREBBP	Q92793	2442 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495		A0A096LNT2	108 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495		K7N7A8	449 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	SCGN	O76038	276 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	QRFP	P83859	136 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	UNC119	Q13432	240 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	SPCS2	Q15005	226 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	GRK1	Q15835	563 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	OR8H2	Q8N162	312 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	NEK7	Q8TDX7	302 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	IFT22	Q9H7X7	185 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	MGST3	O14880	152 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	TK1	P04183	234 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	CD99	P14209	185 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	FOSL1	P15407	271 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	FUT3	P21217	361 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	LMO1	P25800	156 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	IL2RG	P31785	369 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	KCNJ3	P48549	501 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495		Q6P435	159 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	TM2D1	Q9BX74	207 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	KCNK15	Q9H427	330 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	BATF3	Q9NR55	127 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	SPATA2	Q9UM82	520 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	ITPR3	Q14573	2671 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SH3TC1-223	ENST00000513495	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3TC1-223	ENST00000513495		A0A0B4J203	849 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3TC1-223	ENST00000513495		A0A1W2PPH5	198 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3TC1-223	ENST00000513495	DPPA5	A6NC42	116 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3TC1-223	ENST00000513495		A8MXK9	166 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3TC1-223	ENST00000513495	FAM157A	C9JC47	383 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3TC1-223	ENST00000513495	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SH3TC1-223	ENST00000513495	LDLRAD4	O15165	306 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3TC1-223	ENST00000513495	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SH3TC1-223	ENST00000513495	TFF1	P04155	84 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3TC1-223	ENST00000513495	GLA	P06280	429 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3TC1-223	ENST00000513495	MSMB	P08118	114 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3TC1-223	ENST00000513495	AMY2B	P19961	511 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3TC1-223	ENST00000513495	LCN2	P80188	198 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3TC1-223	ENST00000513495	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3TC1-223	ENST00000513495	RAB12	Q6IQ22	244 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3TC1-223	ENST00000513495	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3TC1-223	ENST00000513495	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3TC1-223	ENST00000513495	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		13.08	□□□□□ -0.32

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms