RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494395.1

ITGB1-217, Transcript of integrin subunit beta 1, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB1, Length 562 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1-217ENST00000494395 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 PRSS48Q7RTY5 328 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 LYPD6Q86Y78 171 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 TMEM185AQ8NFB2 350 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 Q8NFD4 153 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 MYDGFQ969H8 173 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 CNBD2Q96M20 576 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 JMJD8Q96S16 334 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 MND1Q9BWT6 205 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 RHOFQ9HBH0 211 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 HMG20AQ9NP66 347 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 ESM1Q9NQ30 184 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 C19orf12Q9NSK7 152 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 TPRKBQ9Y3C4 175 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 MAGEA13PA6NCF6 341 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 M0R1W7 72 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 GABRPO00591 440 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 DENRO43583 198 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 PSPNO60542 156 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 INMTO95050 263 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 HAND1O96004 215 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 TK1P04183 234 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 CHRM2P08172 466 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 HCKP08631 526 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 NDUFB7P17568 137 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 RAB3AP20336 220 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 GP2P55259 537 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 SCGB2A2Q13296 93 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 SPHARQ15513 63 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 ELP2Q6IA86 826 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 Q6P435 159 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 ASCL4Q6XD76 172 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 TCF23Q7RTU1 214 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 ZDHHC22Q8N966 263 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 PXT1Q8NFP0 134 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 C22orf15Q8WYQ4 148 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 TNFRSF14Q92956 283 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 SNX22Q96L94 193 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 DERL3Q96Q80 235 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 OR14A2Q96R54 314 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 PCGF1Q9BSM1 259 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 SUCNR1Q9BXA5 334 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 NEK6Q9HC98 313 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 TMEM138Q9NPI0 162 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 RGS10O43665 173 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 CALCBP10092 127 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 PRKACAP17612 351 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 LMO1P25800 156 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 DUSP1P28562 367 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 BDKRB2P30411 391 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 OR3A4PP47883 348 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 DLX1P56177 255 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 DLX6P56179 175 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 BPIFB3P59826 476 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 GPR50Q13585 617 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 TPBGQ13641 420 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 ZNF273Q14593 569 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 INSL4Q14641 139 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 PDCD1Q15116 288 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 DDI2Q5TDH0 399 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 HCP5Q6MZN7 132 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 PHC2Q8IXK0 858 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 OR8H2Q8N162 312 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 OR51T1Q8NGJ9 327 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 IL36GQ9NZH8 169 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms